RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.68■□□□□ 0.58
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SH3BP2-208ENST00000504294 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
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SH3BP2-208ENST00000504294 VAMP4O75379 141 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 NFIXQ14938 502 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 COPS6Q7L5N1 327 aa18.66■□□□□ 0.58
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SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.65■□□□□ 0.58
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SH3BP2-208ENST00000504294 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.65■□□□□ 0.58
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SH3BP2-208ENST00000504294 SYT17Q9BSW7 474 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP2-208ENST00000504294 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP2-208ENST00000504294 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.62■□□□□ 0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.59■□□□□ 0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
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SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-208ENST00000504294 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
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SH3BP2-208ENST00000504294 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.52■□□□□ 0.56
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SH3BP2-208ENST00000504294 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR162Q16538 588 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 SUSD4Q5VX71 490 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP2-208ENST00000504294 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.5■□□□□ 0.55
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SH3BP2-208ENST00000504294 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 NLRP3Q96P20 1036 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 MYD88Q99836 296 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP98P52948 1817 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 CNKSR1Q969H4 720 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-208ENST00000504294 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.49■□□□□ 0.55
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