RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.08■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.08■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.08■□□□□ 0.81
SYP-208ENST00000494396 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 F6X3S4 739 aa20.07■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 MEIS3Q99687 375 aa20.07■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.07■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.07■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 TSPY26PQ9H489 355 aa20.07■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 TOM1O60784 492 aa20.06■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 IL2RBP14784 551 aa20.06■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.06■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 SYCE3A1L190 88 aa20.06■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 CEP85Q6P2H3 762 aa20.06■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.06■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.06■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.05■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 ERC2O15083 957 aa20.05■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 BTG4Q9NY30 223 aa20.05■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 PKP1Q13835 747 aa20.04■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.04■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 BRD1O95696 1058 aa20.04■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 MRC1P22897 1456 aa20.03■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 ZNF790Q6PG37 636 aa20.03■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 SDSP20132 328 aa20.03■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 ANAPC15P60006 121 aa20.03■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 CUL4AQ13619 759 aa20.03■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.03■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 PHLPP1O60346 1717 aa20.02■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.02■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 IL17RAQ96F46 866 aa20.02■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.02■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.02■□□□□ 0.8
SYP-208ENST00000494396 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 MCCP23508 829 aa20■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 CABP4P57796 275 aa20■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 PIP4K2BP78356 416 aa20■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 DMTNQ08495 405 aa19.99■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 SLC39A6Q13433 755 aa19.99■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.98■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 HMMRO75330 724 aa19.98■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 GNAI2P04899 355 aa19.98■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 TMX3Q96JJ7 454 aa19.98■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 TPM3P06753 285 aa19.97■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 GNAI3P08754 354 aa19.97■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 ERVV-2B6SEH9 535 aa19.96■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 TMEM87AQ8NBN3 555 aa19.96■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 SPTLC3Q9NUV7 552 aa19.96■□□□□ 0.79
SYP-208ENST00000494396 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.95■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 UBAP1LF5GYI3 381 aa19.95■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.95■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 NEK4P51957 841 aa19.94■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 HYPKQ9NX55 129 aa19.94■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 KIF20AO95235 890 aa19.93■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 ADAMTS2O95450 1211 aa19.93■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.93■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 ANXA1P04083 346 aa19.93■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 KIF3AQ9Y496 699 aa19.93■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 USP44Q9H0E7 712 aa19.92■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 CCDC183Q5T5S1 534 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 RNF214Q8ND24 703 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 PROSER3Q2NL68 480 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 DISP2A7MBM2 1401 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.91■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 ATP8B2P98198 1209 aa19.9■□□□□ 0.78
SYP-208ENST00000494396 C5P01031 1676 aa19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms