RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488774.1

PTPRD-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRD, Length 420 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-212ENST00000488774 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 NARFQ9UHQ1 456 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 KCNA3P22001 575 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 RFC4P35249 363 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 STARD3NLO95772 234 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 NEFMP07197 916 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 CCDC27Q2M243 656 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 KLHL34Q8N239 644 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 IFT57Q9NWB7 429 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 MYH3P11055 1940 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRD-212ENST00000488774 CCER2I3L3R5 266 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 G2E3Q7L622 706 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 SYNE4Q8N205 404 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 ABCC12Q96J65 1359 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 A0A0G2JLW4 131 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 CHRNA5P30532 468 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 DPEP1P16444 411 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1B0GUL6 1792 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 FAM177BA6PVY3 158 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 ZPR1O75312 459 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 VAMP4O75379 141 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 SERPINB2P05120 415 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 GPTP24298 496 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 POLD1P28340 1107 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 PRELPP51888 382 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 GNAI1P63096 354 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 COPS6Q7L5N1 327 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 IL16Q14005 1332 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 SUSD4Q5VX71 490 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 WDR63Q8IWG1 891 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 ADCY9O60503 1353 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 ATP10DQ9P241 1426 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 SLFN5Q08AF3 891 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 OLFM4Q6UX06 510 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRD-212ENST00000488774 A0A087WZG4 1122 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 NTSR2O95665 410 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 ERFEQ4G0M1 354 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 ERBB4Q15303 1308 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 COL4A5P29400 1685 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 LTBP1Q14766 1721 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 HOXB7P09629 217 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 TNNQ9UQP3 1299 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 SNED1Q8TER0 1413 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 IGKV5-2P06315 115 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 NLRP10Q86W26 655 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 SETDB2Q96T68 719 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 ISCA1Q9BUE6 129 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 F6X3S4 739 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRD-212ENST00000488774 TCIRG1Q13488 830 aa8.43□□□□□ -1.06
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