RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488161.1

C7orf49-212, humanhuman

TSL 3

Gene C7orf49, Length 124 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-212ENST00000488161 PDIA6Q15084 440 aa8.64□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.64□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.64□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.64□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.63□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF853P0CG23 659 aa8.63□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 TGFB2P61812 414 aa8.63□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.63□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF428Q96B54 188 aa8.63□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ABCC12Q96J65 1359 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 GPTP24298 496 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 CFAP44Q96MT7 982 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 SETDB2Q96T68 719 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 GRIN3BO60391 1043 aa8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 TSPYL6Q8N831 410 aa8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 CNBD1Q8NA66 436 aa8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 IFT57Q9NWB7 429 aa8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ATP10DQ9P241 1426 aa8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 SLX4Q8IY92 1834 aa8.61□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ERBB4Q15303 1308 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 NPHP1O15259 732 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 RASSF7Q02833 373 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 SLC51AQ86UW1 340 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 WWC1Q8IX03 1113 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 PIM2Q9P1W9 311 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF652Q9Y2D9 606 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 LAMB2P55268 1798 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ADCY9O60503 1353 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 GNAI1P63096 354 aa8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 COPS6Q7L5N1 327 aa8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 SBF1O95248 1867 aa8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-212ENST00000488161 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 H0YIN7 160 aa8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 PRELPP51888 382 aa8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 ST5P78524 1137 aa8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 ERFEQ4G0M1 354 aa8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 SUSD4Q5VX71 490 aa8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 NTSR2O95665 410 aa8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 CCDC27Q2M243 656 aa8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 OLFM4Q6UX06 510 aa8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 SYNE4Q8N205 404 aa8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 COL4A1P02462 1669 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 TAF1P21675 1872 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 C21orf2O43822 256 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 HOXB7P09629 217 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 SRGNP10124 158 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 PDE6BP35913 854 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 TTLL6Q8N841 843 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 NFKBIEO00221 500 aa8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 RGL2O15211 777 aa8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 RNF181Q9P0P0 153 aa8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 IL16Q14005 1332 aa8.54□□□□□ -1.04
C7orf49-212ENST00000488161 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms