RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TRAPPC10-211ENST00000485621 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.71□□□□□ -0.53
TRAPPC10-211ENST00000485621 KLF15Q9UIH9 416 aa11.71□□□□□ -0.53
TRAPPC10-211ENST00000485621 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.71□□□□□ -0.53
TRAPPC10-211ENST00000485621 EFSO43281 561 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 SIX5Q8N196 739 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-211ENST00000485621 MSTNO14793 375 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-211ENST00000485621 LAMC2Q13753 1193 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 GRIN2CQ14957 1233 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHSY3Q70JA7 882 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 COL8A1P27658 744 aa11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 GNB5O14775 395 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 ITGB2P05107 769 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 KRBA1A5PL33 1030 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 PIK3R2O00459 728 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 DGKGP49619 791 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 SEC13P55735 322 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 SYT9Q86SS6 491 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC10-211ENST00000485621 HSH2DQ96JZ2 352 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-211ENST00000485621 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 A6NJR5 290 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 C21orf2O43822 256 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 CEP63Q96MT8 703 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 HINFPQ9BQA5 517 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 LGR5O75473 907 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 NGLY1Q96IV0 654 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC30A3Q99726 388 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 BRD7Q9NPI1 651 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 PROCP04070 461 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRAPPC10-211ENST00000485621 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 POTEAQ6S8J7 498 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 ALAS2P22557 587 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 DPYDQ12882 1025 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 ELOA3BQ3SY89 546 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 ELOA3Q8NG57 546 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 SUSD3Q96L08 255 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPEM2Q0P670 501 aa11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 SIN3BO75182 1162 aa11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 PTK7Q13308 1070 aa11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 TYRO3Q06418 890 aa11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 NEUROD1Q13562 356 aa11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L15C9J2P7 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L10C9JJH3 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L12C9JPN9 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L11C9JVI0 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L21D6R901 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L18D6R9N7 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L22D6RA61 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L19D6RCP7 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L20D6RJB6 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 USP17L24Q0WX57 530 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 LOC100996750A0A140TA64 210 aa11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRIM11Q96F44 468 aa11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM196BA6NMK8 535 aa11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 BTLAQ7Z6A9 289 aa11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 PLVAPQ9BX97 442 aa11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC10-211ENST00000485621 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.52□□□□□ -0.57
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIF1AQ16665 826 aa11.52□□□□□ -0.57
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