RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482519.1

VAMP4-204, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene VAMP4, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-204ENST00000482519 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.58■■□□□ 1.05
VAMP4-204ENST00000482519 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.58■■□□□ 1.05
VAMP4-204ENST00000482519 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.58■■□□□ 1.05
VAMP4-204ENST00000482519 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
VAMP4-204ENST00000482519 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.58■■□□□ 1.05
VAMP4-204ENST00000482519 CNBD1Q8NA66 436 aa21.58■■□□□ 1.05
VAMP4-204ENST00000482519 CFAP44Q96MT7 982 aa21.58■■□□□ 1.05
VAMP4-204ENST00000482519 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
VAMP4-204ENST00000482519 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 H0YIN7 160 aa21.56■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 ANXA1P04083 346 aa21.56■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 ST5P78524 1137 aa21.56■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.56■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 MBIPQ9NS73 344 aa21.56■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 ERBB4Q15303 1308 aa21.55■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 PDE6BP35913 854 aa21.55■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 PROSER3Q2NL68 480 aa21.55■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.55■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.55■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 GNAI1P63096 354 aa21.54■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 IFT57Q9NWB7 429 aa21.54■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.53■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 PDIA6Q15084 440 aa21.53■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.044e-6■□□□□ 9.9
VAMP4-204ENST00000482519 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.52■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 RGL2O15211 777 aa21.52■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.52■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.52■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.52■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 NUP98P52948 1817 aa21.52■■□□□ 1.04
VAMP4-204ENST00000482519 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.51■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF853P0CG23 659 aa21.51■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 GPTP24298 496 aa21.51■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.51■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 TTLL6Q8N841 843 aa21.51■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 COPS6Q7L5N1 327 aa21.5■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.5■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.49■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.49■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.48■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.48■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 ATP10DQ9P241 1426 aa21.47■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 HOXB7P09629 217 aa21.47■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 WWC1Q8IX03 1113 aa21.47■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.46■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 NYXQ9GZU5 481 aa21.46■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
VAMP4-204ENST00000482519 CCDC27Q2M243 656 aa21.45■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 SRGNP10124 158 aa21.44■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 ERFEQ4G0M1 354 aa21.44■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 SUSD4Q5VX71 490 aa21.44■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.44■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.44■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 MASTLQ96GX5 879 aa21.44■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.44■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 C21orf2O43822 256 aa21.43■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.43■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 STYK1Q6J9G0 422 aa21.43■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 CNKSR1Q969H4 720 aa21.43■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 ADCY9O60503 1353 aa21.42■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 CACNA1SQ13698 1873 aa21.42■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 HYPKQ9NX55 129 aa21.42■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 RASSF7Q02833 373 aa21.41■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.41■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 RNF181Q9P0P0 153 aa21.41■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 ABCC12Q96J65 1359 aa21.4■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 NPR1P16066 1061 aa21.4■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 PARP10Q53GL7 1025 aa21.4■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.4■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.4■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 TSPYL6Q8N831 410 aa21.4■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF428Q96B54 188 aa21.4■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 SLX4Q8IY92 1834 aa21.39■■□□□ 1.02
VAMP4-204ENST00000482519 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 NTSR2O95665 410 aa21.38■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 TCIRG1Q13488 830 aa21.38■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.38■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 IL16Q14005 1332 aa21.37■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.37■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.36■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
VAMP4-204ENST00000482519 NLRP10Q86W26 655 aa21.36■■□□□ 1.01
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