RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.25	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.24	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	FKBP8	Q14318	412 aa		31.22	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		31.22	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		31.22	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		31.21	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.21	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.21	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	MSL1	Q68DK7	614 aa		31.2	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	G2E3	Q7L622	706 aa		31.2	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.2	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		31.2	■■■□□ 2.59
KCNS3-205	ENST00000481414	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.19	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	FLII	Q13045	1269 aa		31.19	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	HLF	Q16534	295 aa		31.19	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.17	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	TM4SF1	P30408	202 aa		31.17	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.17	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.16	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	PTGER2	P43116	358 aa		31.16	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.16	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	POLD1	P28340	1107 aa		31.15	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	NFIX	Q14938	502 aa		31.15	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		31.14	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.14	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.14	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.14	■■■□□ 2.58
KCNS3-205	ENST00000481414	MMP10	P09238	476 aa		31.13	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.13	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	ATP10D	Q9P241	1426 aa		31.12	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.11	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.11	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.11	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	SETDB2	Q96T68	719 aa		31.11	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		31.1	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	31.1	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	ADCY9	O60503	1353 aa		31.09	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	PTPRC	P08575	1304 aa		31.09	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	DDR1	Q08345	913 aa		31.09	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		31.09	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.09	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		31.09	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	NUP98	P52948	1817 aa		31.08	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
KCNS3-205	ENST00000481414	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		31.06	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	BCAR3	O75815	825 aa		31.06	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.05	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.05	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.04	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	SERPINB2	P05120	415 aa		31.04	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	GPT	P24298	496 aa		31.04	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.04	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		31.03	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		31.03	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		31.02	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		31.02	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	MYD88	Q99836	296 aa		31.02	■■■□□ 2.56
KCNS3-205	ENST00000481414	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.01	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	NLRP10	Q86W26	655 aa		31.01	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	LRP5	O75197	1615 aa		31.01	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414		F6X3S4	739 aa		31	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		31	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	SUSD4	Q5VX71	490 aa		30.99	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		30.99	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		30.98	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		30.98	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	NYX	Q9GZU5	481 aa		30.98	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	IGKV5-2	P06315	115 aa		30.97	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		30.97	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	LINS1	Q8NG48	757 aa		30.97	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		30.96	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	CNBD1	Q8NA66	436 aa		30.96	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	30.96	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	30.96	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	BEND3	Q5T5X7	828 aa		30.95	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		30.95	■■■□□ 2.55
KCNS3-205	ENST00000481414	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		30.95	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM177B	A6PVY3	158 aa		30.94	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	NTSR2	O95665	410 aa		30.94	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		30.93	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		30.93	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		30.93	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		30.93	■■■□□ 2.54

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