RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.21■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.21■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 IL16Q14005 1332 aa27.2■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.2■■□□□ 1.95
ACTB-211ENST00000480301 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.2■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.2■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.2■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.19■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.19■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.19■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 KCNA3P22001 575 aa27.18■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.18■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 WDR63Q8IWG1 891 aa27.18■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.17■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.16■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 GRIN3BO60391 1043 aa27.15■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 CHRNA5P30532 468 aa27.15■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 COPS6Q7L5N1 327 aa27.15■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.15■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 UTRNP46939 3433 aa27.15■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.14■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 TSPYL6Q8N831 410 aa27.14■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
ACTB-211ENST00000480301 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 CNBD1Q8NA66 436 aa27.12■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 ATP10DQ9P241 1426 aa27.11■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.11■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 PIM2Q9P1W9 311 aa27.11■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.1■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 MIER1Q8N108 512 aa27.1■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 BCS1LQ9Y276 419 aa27.1■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.1■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 HYPKQ9NX55 129 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 ZNF521Q96K83 1311 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 FAM177BA6PVY3 158 aa27.08■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 ST5P78524 1137 aa27.08■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 NUP98P52948 1817 aa27.08■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
ACTB-211ENST00000480301 NPHP1O15259 732 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 GPTP24298 496 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 YY1P25490 414 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 PDE6BP35913 854 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 H0YIN7 160 aa27.06■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.06■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.06■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 SUSD4Q5VX71 490 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA2Q08379 1002 aa27.03■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 NYXQ9GZU5 481 aa27.03■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 TCIRG1Q13488 830 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 PARP10Q53GL7 1025 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.02■■□□□ 1.92
ACTB-211ENST00000480301 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.01■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.01■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 VAMP4O75379 141 aa27■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 NTSR2O95665 410 aa27■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 TTLL6Q8N841 843 aa27■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 CHD4Q14839 1912 aa26.99■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 SRGNP10124 158 aa26.99■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 ERFEQ4G0M1 354 aa26.99■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 NLRP10Q86W26 655 aa26.98■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 ABCC12Q96J65 1359 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 STYK1Q6J9G0 422 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 MASTLQ96GX5 879 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 STK31Q9BXU1 1019 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTB-211ENST00000480301 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.95■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 SLC4A2P04920 1241 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.94■■□□□ 1.9
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