RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.12■■■□□ 2.41
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C9orf3-216ENST00000478603 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
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C9orf3-216ENST00000478603 HLFQ16534 295 aa30.1■■■□□ 2.41
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C9orf3-216ENST00000478603 NUP98P52948 1817 aa30.06■■■□□ 2.4
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C9orf3-216ENST00000478603 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
C9orf3-216ENST00000478603 COPS6Q7L5N1 327 aa29.82■■■□□ 2.36
C9orf3-216ENST00000478603 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
C9orf3-216ENST00000478603 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.82■■■□□ 2.36
C9orf3-216ENST00000478603 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.81■■■□□ 2.36
C9orf3-216ENST00000478603 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.8■■■□□ 2.36
C9orf3-216ENST00000478603 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
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