RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF652Q9Y2D9 606 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXB3-208ENST00000476342 RGL2O15211 777 aa38.03■■■■□ 3.68
HOXB3-208ENST00000476342 MMP10P09238 476 aa38.01■■■■□ 3.68
HOXB3-208ENST00000476342 CLEC4GQ6UXB4 293 aa38.01■■■■□ 3.68
HOXB3-208ENST00000476342 TTLL7Q6ZT98 887 aa38.01■■■■□ 3.68
HOXB3-208ENST00000476342 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa38■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 CACNA1FO60840 1977 aa38■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 COPS6Q7L5N1 327 aa38■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 XAGE3Q8WTP9 111 aa38■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 ERVV-1B6SEH8 477 aa37.99■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 PARP3Q9Y6F1 533 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 NUP98P52948 1817 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 TM4SF1P30408 202 aa37.95■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 ZBTB3Q9H5J0 574 aa37.95■■■■□ 3.67
HOXB3-208ENST00000476342 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 NFIXQ14938 502 aa37.94■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 TBC1D9BQ66K14 1250 aa37.93■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 SLC4A2P04920 1241 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 HLFQ16534 295 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 BICDL1Q6ZP65 573 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF428Q96B54 188 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 SETDB2Q96T68 719 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 DDR1Q08345 913 aa37.9■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 CARMIL3Q8ND23 1372 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa37.88■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 PLBD2Q8NHP8 589 aa37.88■■■■□ 3.66
HOXB3-208ENST00000476342 ATP10DQ9P241 1426 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 DDX58O95786 925 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa37.86■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 NRXN2Q9P2S2 1712 aa37.84■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 SERPINB2P05120 415 aa37.84■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 KLHL34Q8N239 644 aa37.84■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 RIC3Q7Z5B4 369 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
HOXB3-208ENST00000476342 FLIIQ13045 1269 aa37.82■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 G2E3Q7L622 706 aa37.81■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 ALDH1L2Q3SY69 923 aa37.79■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 CD2APQ9Y5K6 639 aa37.79■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 C10orf71Q711Q0 1435 aa37.79■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 GPTP24298 496 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 TCIRG1Q13488 830 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF34Q8IZ26 560 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 KIF13BQ9NQT8 1826 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 NPHP1O15259 732 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 PARP10Q53GL7 1025 aa37.77■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 KSR2Q6VAB6 950 aa37.77■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
HOXB3-208ENST00000476342 SSH1Q8WYL5 1049 aa37.76■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 SYT17Q9BSW7 474 aa37.76■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 CNBD1Q8NA66 436 aa37.75■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 UBN2Q6ZU65 1347 aa37.75■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 PI4KAP2A4QPH2 592 aa37.74■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa37.74■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 NYXQ9GZU5 481 aa37.74■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 TPTE2Q6XPS3 522 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 SMC4Q9NTJ3 1288 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 ADCY9O60503 1353 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 PRR5LQ6MZQ0 368 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 FAM177BA6PVY3 158 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 ST5P78524 1137 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 BCL2L13Q9BXK5 485 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
HOXB3-208ENST00000476342 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 NEXNQ0ZGT2 675 aa37.69■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 MYD88Q99836 296 aa37.69■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 ISCA1Q9BUE6 129 aa37.69■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 RARSP54136 660 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 SUSD4Q5VX71 490 aa37.68■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 NLRP10Q86W26 655 aa37.68■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa37.67■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 TGFB2P61812 414 aa37.66■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 DNAAF4Q8WXU2 420 aa37.66■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 PTPRCP08575 1304 aa37.66■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 NLGN2Q8NFZ4 835 aa37.65■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 RNF123Q5XPI4 1314 aa37.65■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 NTSR2O95665 410 aa37.64■■■■□ 3.62
HOXB3-208ENST00000476342 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
HOXB3-208ENST00000476342 BRIP1Q9BX63 1249 aa37.63■■■■□ 3.61
HOXB3-208ENST00000476342 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa37.63■■■■□ 3.61
HOXB3-208ENST00000476342 CCDC24Q8N4L8 307 aa37.62■■■■□ 3.61
HOXB3-208ENST00000476342 PXDNLA1KZ92 1463 aa37.62■■■■□ 3.61
HOXB3-208ENST00000476342 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa37.62■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms