RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 NFE2L2Q16236 605 aa26.15■■□□□ 1.78
COL9A3-210ENST00000472880 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
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COL9A3-210ENST00000472880 RRAGCQ9HB90 399 aa26.15■■□□□ 1.78
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
COL9A3-210ENST00000472880 NBPF26B4DH59 902 aa26.14■■□□□ 1.78
COL9A3-210ENST00000472880 C21orf2O43822 256 aa26.14■■□□□ 1.78
COL9A3-210ENST00000472880 PRELPP51888 382 aa26.14■■□□□ 1.78
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COL9A3-210ENST00000472880 NBPF15Q8N660 670 aa26.14■■□□□ 1.78
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COL9A3-210ENST00000472880 STYK1Q6J9G0 422 aa26.12■■□□□ 1.77
COL9A3-210ENST00000472880 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.11■■□□□ 1.77
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COL9A3-210ENST00000472880 FSTL1Q12841 308 aa26.11■■□□□ 1.77
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COL9A3-210ENST00000472880 SOGA3Q5TF21 947 aa26.08■■□□□ 1.77
COL9A3-210ENST00000472880 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.08■■□□□ 1.77
COL9A3-210ENST00000472880 SLX4Q8IY92 1834 aa26.08■■□□□ 1.77
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COL9A3-210ENST00000472880 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 FAM177BA6PVY3 158 aa26.05■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 HLFQ16534 295 aa26.05■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 ERFEQ4G0M1 354 aa26.05■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 NGEFQ8N5V2 710 aa26.05■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.05■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 NPR1P16066 1061 aa26.04■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.04■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.03■■□□□ 1.76
COL9A3-210ENST00000472880 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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COL9A3-210ENST00000472880 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.01■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 CCDC93Q567U6 631 aa26.01■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.01■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 NUP98P52948 1817 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 MYL6BP14649 208 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 RIPK4P57078 832 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 NYXQ9GZU5 481 aa26■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 ERBB4Q15303 1308 aa25.99■■□□□ 1.75
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COL9A3-210ENST00000472880 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.99■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.99■■□□□ 1.75
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COL9A3-210ENST00000472880 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.97■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 ABCC12Q96J65 1359 aa25.96■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 HTRA3P83110 453 aa25.96■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
COL9A3-210ENST00000472880 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
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COL9A3-210ENST00000472880 ALDH1B1P30837 517 aa25.94■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.94■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.94■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 POTECB2RU33 542 aa25.93■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 KLRG1Q96E93 195 aa25.93■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.93■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.92■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.92■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 CRY2Q49AN0 593 aa25.91■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.91■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 OLFM4Q6UX06 510 aa25.9■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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COL9A3-210ENST00000472880 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 NEUROD2Q15784 382 aa25.89■■□□□ 1.74
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COL9A3-210ENST00000472880 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.89■■□□□ 1.74
COL9A3-210ENST00000472880 SUSD4Q5VX71 490 aa25.88■■□□□ 1.73
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COL9A3-210ENST00000472880 PARP10Q53GL7 1025 aa25.86■■□□□ 1.73
COL9A3-210ENST00000472880 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.86■■□□□ 1.73
COL9A3-210ENST00000472880 RUNDC1Q96C34 613 aa25.86■■□□□ 1.73
COL9A3-210ENST00000472880 ANXA1P04083 346 aa25.85■■□□□ 1.73
COL9A3-210ENST00000472880 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
COL9A3-210ENST00000472880 PROSER3Q2NL68 480 aa25.85■■□□□ 1.73
COL9A3-210ENST00000472880 SCN4AP35499 1836 aa25.84■■□□□ 1.73
COL9A3-210ENST00000472880 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
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