RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469389.5

SYP-204, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-204ENST00000469389 KIF16BQ96L93 1317 aa20.15■□□□□ 0.82
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SYP-204ENST00000469389 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.14■□□□□ 0.81
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SYP-204ENST00000469389 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.14■□□□□ 0.81
SYP-204ENST00000469389 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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SYP-204ENST00000469389 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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SYP-204ENST00000469389 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.02■□□□□ 0.8
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SYP-204ENST00000469389 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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SYP-204ENST00000469389 FAM177BA6PVY3 158 aa20■□□□□ 0.79
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SYP-204ENST00000469389 ST5P78524 1137 aa20■□□□□ 0.79
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SYP-204ENST00000469389 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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SYP-204ENST00000469389 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SYP-204ENST00000469389 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.98■□□□□ 0.79
SYP-204ENST00000469389 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SYP-204ENST00000469389 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SYP-204ENST00000469389 ALDH1L1O75891 902 aa19.97■□□□□ 0.79
SYP-204ENST00000469389 NLRP10Q86W26 655 aa19.97■□□□□ 0.79
SYP-204ENST00000469389 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
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