RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 JAG2Q9Y219 1238 aa5.6□□□□□ -1.51
SHQ1-204ENST00000468347 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SHQ1-204ENST00000468347 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.59□□□□□ -1.51
SHQ1-204ENST00000468347 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.59□□□□□ -1.51
SHQ1-204ENST00000468347 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 PNMA1Q8ND90 353 aa5.58□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.58□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 AIDAQ96BJ3 306 aa5.57□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.56□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 CBLL1Q75N03 491 aa5.56□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.56□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 ITGB5P18084 799 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 ESCO1Q5FWF5 840 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 IGF2-ASQ6U949 168 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 FBXO11Q86XK2 927 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 EPS8L1Q8TE68 723 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 SLC30A3Q99726 388 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 RAXQ9Y2V3 346 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.54□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 TLR1Q15399 786 aa5.54□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.53□□□□□ -1.52
SHQ1-204ENST00000468347 NUDT8Q8WV74 236 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 PRR19A6NJB7 356 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 CLK2P49760 499 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 NEUROD1Q13562 356 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 PARP9Q8IXQ6 854 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 STOML1Q9UBI4 398 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 SPEM2Q0P670 501 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 NFIAQ12857 509 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 ALX3O95076 343 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 MYCP01106 439 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 PKN1Q16512 942 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 MSL1Q68DK7 614 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-204ENST00000468347 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 ZBBXA8MT70 800 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 Q6ZS46 218 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 F8W735 103 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 SOCS7O14512 581 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 DLL1O00548 723 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 CSRNP1Q96S65 589 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 FBXO45P0C2W1 286 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 COL19A1Q14993 1142 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 RNF43Q68DV7 783 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 NAGPAQ9UK23 515 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.41□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 PSPNO60542 156 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-204ENST00000468347 PAPLNO95428 1278 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 GLB1P16278 677 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 GRIK5Q16478 980 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 NFXL1Q6ZNB6 911 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 KSR1Q8IVT5 923 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 FBXL18Q96ME1 805 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC39Q9UFE4 941 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 AP1G2O75843 785 aa5.38□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.38□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.38□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.38□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 BHMTQ93088 406 aa5.38□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 IGFLR1Q9H665 355 aa5.38□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.38□□□□□ -1.55
SHQ1-204ENST00000468347 SMTNP53814 917 aa5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms