RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.66	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	TJP1	Q07157	1748 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	NPHP1	O15259	732 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	CAMTA2	O94983	1202 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	POLD1	P28340	1107 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	KSR2	Q6VAB6	950 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	SETDB2	Q96T68	719 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	MTFR1L	Q9H019	292 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	SPON1	Q9HCB6	807 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	C5	P01031	1676 aa		10.65	□□□□□ -0.7
IL6-208	ENST00000464710	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	RREB1	Q92766	1687 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	GPT	P24298	496 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	MYD88	Q99836	296 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10.64	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710		F6X3S4	739 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	MMP10	P09238	476 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	NFIX	Q14938	502 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	KLHL34	Q8N239	644 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	SERPINB2	P05120	415 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	TM4SF1	P30408	202 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	EP400	Q96L91	3159 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	PTPRC	P08575	1304 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	SUSD4	Q5VX71	490 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	RGL2	O15211	777 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	PLIN1	O60240	522 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.59	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.58	□□□□□ -0.71
IL6-208	ENST00000464710	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	DDR1	Q08345	913 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	NLRP10	Q86W26	655 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	ADCY9	O60503	1353 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	MS4A1	P11836	297 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	PTGER2	P43116	358 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	ST5	P78524	1137 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	CNBD1	Q8NA66	436 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.57	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		10.56	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.56	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.56	□□□□□ -0.72
IL6-208	ENST00000464710	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72

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