RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.75■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.75■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.74■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 NUP98P52948 1817 aa23.74■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.74■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.74■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.73■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.73■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.73■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 TSPYL6Q8N831 410 aa23.73■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 SETDB2Q96T68 719 aa23.73■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.73■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.72■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 SERPINB2P05120 415 aa23.72■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.72■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 HYPKQ9NX55 129 aa23.72■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.71■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 COPS6Q7L5N1 327 aa23.71■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.71■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.71■■□□□ 1.39
DDR1-241ENST00000460944 E9PSI1 815 aa23.7■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 NPHP1O15259 732 aa23.7■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 HLFQ16534 295 aa23.7■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 STK31Q9BXU1 1019 aa23.7■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 CACNA1FO60840 1977 aa23.68■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 ATP10DQ9P241 1426 aa23.67■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 TGFB2P61812 414 aa23.66■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 CNBD1Q8NA66 436 aa23.66■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.65■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.65■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
DDR1-241ENST00000460944 ST5P78524 1137 aa23.64■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 SLFN5Q08AF3 891 aa23.64■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.63■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 VAMP4O75379 141 aa23.63■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 GPTP24298 496 aa23.63■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.63■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.63■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.63■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.62■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 FAM177BA6PVY3 158 aa23.62■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.62■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.61■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 GPR162Q16538 588 aa23.61■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 PARP10Q53GL7 1025 aa23.61■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 NYXQ9GZU5 481 aa23.61■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 SLC4A2P04920 1241 aa23.6■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.6■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.6■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.6■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.6■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 A0A0G2JLW4 131 aa23.59■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 DPEP1P16444 411 aa23.59■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.59■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.59■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 PDE6BP35913 854 aa23.58■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 TCIRG1Q13488 830 aa23.58■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.58■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.58■■□□□ 1.37
DDR1-241ENST00000460944 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.57■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.56■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.55■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 H0YIN7 160 aa23.55■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 CHRNA5P30532 468 aa23.55■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 SUSD4Q5VX71 490 aa23.55■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.55■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 PIM2Q9P1W9 311 aa23.55■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 FLIIQ13045 1269 aa23.54■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.54■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 GRIN3BO60391 1043 aa23.53■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 NTSR2O95665 410 aa23.53■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 KSR2Q6VAB6 950 aa23.53■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 G2E3Q7L622 706 aa23.53■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 NLRP10Q86W26 655 aa23.53■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.53■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.52■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.52■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 ZNF428Q96B54 188 aa23.52■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 MYD88Q99836 296 aa23.52■■□□□ 1.36
DDR1-241ENST00000460944 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.52■■□□□ 1.36
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