RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 SSH1Q8WYL5 1049 aa13.15□□□□□ -0.3
GARNL3-211ENST00000460176 STK31Q9BXU1 1019 aa13.15□□□□□ -0.3
GARNL3-211ENST00000460176 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa13.15□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 NUP98P52948 1817 aa13.14□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 PHF14O94880 888 aa13.14□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 G2E3Q7L622 706 aa13.14□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.14□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 HYPKQ9NX55 129 aa13.14□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 COL24A1Q17RW2 1714 aa13.13□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 XAGE3Q8WTP9 111 aa13.13□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.13□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 A0A087WZG4 1122 aa13.12□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 TRAPPC3LQ5T215 181 aa13.12□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.12□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 COPS6Q7L5N1 327 aa13.12□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 FLAD1Q8NFF5 587 aa13.12□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 BCAR3O75815 825 aa13.11□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 FLIIQ13045 1269 aa13.11□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 NARFQ9UHQ1 456 aa13.11□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.11□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa13.11□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 CAMTA2O94983 1202 aa13.1□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 RFC4P35249 363 aa13.1□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 KIF6Q6ZMV9 814 aa13.1□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.1□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa13.1□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 ADCY9O60503 1353 aa13.09□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 USPL1Q5W0Q7 1092 aa13.09□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 PLBD2Q8NHP8 589 aa13.09□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 ZBTB3Q9H5J0 574 aa13.09□□□□□ -0.31
GARNL3-211ENST00000460176 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.08□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 RGL2O15211 777 aa13.08□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ABCB7O75027 752 aa13.08□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 GYS1P13807 737 aa13.08□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ARXQ96QS3 562 aa13.08□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 PTPRCP08575 1304 aa13.08□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 KIF16BQ96L93 1317 aa13.08□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ZPR1O75312 459 aa13.07□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 DDX58O95786 925 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 HLFQ16534 295 aa13.07□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 KSR2Q6VAB6 950 aa13.07□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.07□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ATP10DQ9P241 1426 aa13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 PXDNLA1KZ92 1463 aa13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 NRXN2Q9P2S2 1712 aa13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 PI4KAP2A4QPH2 592 aa13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 F6X3S4 739 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ARHGAP45Q92619 1136 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF652Q9Y2D9 606 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 TBC1D9BQ66K14 1250 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 TNNQ9UQP3 1299 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 TRIM27P14373 513 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 TCIRG1Q13488 830 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 MSL1Q68DK7 614 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 NLGN1Q8N2Q7 840 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 MYD88Q99836 296 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ISCA1Q9BUE6 129 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-211ENST00000460176 ZBTB7AO95365 584 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 GPTP24298 496 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 TM4SF1P30408 202 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 NFIXQ14938 502 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 MTFR1LQ9H019 292 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 ABCC4O15439 1325 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 LAMB2P55268 1798 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-211ENST00000460176 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms