RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 NECTIN2Q92692 538 aa21.81■■□□□ 1.08
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RABGEF1-204ENST00000442563 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA2Q08379 1002 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 HLFQ16534 295 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 HYPKQ9NX55 129 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SCN7AQ01118 1682 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 ANXA1P04083 346 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 COPS6Q7L5N1 327 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPYL6Q8N831 410 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 BCORQ6W2J9 1755 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR162Q16538 588 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP10DQ9P241 1426 aa21.72■■□□□ 1.07
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RABGEF1-204ENST00000442563 E9PSI1 815 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 VAMP4O75379 141 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 DPEP1P16444 411 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CNBD1Q8NA66 436 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNA3P22001 575 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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RABGEF1-204ENST00000442563 ST5P78524 1137 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 SLFN5Q08AF3 891 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 TCIRG1Q13488 830 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 STK31Q9BXU1 1019 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 PDE6BP35913 854 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 PARP10Q53GL7 1025 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 NYXQ9GZU5 481 aa21.69■■□□□ 1.06
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RABGEF1-204ENST00000442563 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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RABGEF1-204ENST00000442563 H0YIN7 160 aa21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC4A2P04920 1241 aa21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 GPTP24298 496 aa21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 CHRNA5P30532 468 aa21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 SUSD4Q5VX71 490 aa21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.66■■□□□ 1.06
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RABGEF1-204ENST00000442563 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.64■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.64■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM177BA6PVY3 158 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 NLRP10Q86W26 655 aa21.63■■□□□ 1.05
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RABGEF1-204ENST00000442563 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.61■■□□□ 1.05
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RABGEF1-204ENST00000442563 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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RABGEF1-204ENST00000442563 STYK1Q6J9G0 422 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 G2E3Q7L622 706 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 TTLL6Q8N841 843 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF428Q96B54 188 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 MASTLQ96GX5 879 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.59■■□□□ 1.05
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