RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431381.5

CITED1-206, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CITED1, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-206ENST00000431381 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.5■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 ALDH1L1O75891 902 aa16.49■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 GNAI3P08754 354 aa16.49■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.49■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 BEND3Q5T5X7 828 aa16.49■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 LINS1Q8NG48 757 aa16.49■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 ATP10DQ9P241 1426 aa16.49■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.48■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 A0A087WZG4 1122 aa16.48■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 AK7Q96M32 723 aa16.48■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.48■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 GNPATO15228 680 aa16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 MEIS3Q99687 375 aa16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 RREB1Q92766 1687 aa16.46■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.46■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 TXNRD1Q16881 649 aa16.46■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16.46■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.46■□□□□ 0.23
CITED1-206ENST00000431381 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa16.45■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 PLSCR1O15162 318 aa16.45■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 GNAI2P04899 355 aa16.45■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 COL15A1P39059 1388 aa16.45■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 C4BP0C0L5 1744 aa16.45■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 NEURL1BA8MQ27 555 aa16.44■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 RPS6KA4O75676 772 aa16.44■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.44■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 ERVV-1B6SEH8 477 aa16.43■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 GRM8O00222 908 aa16.43■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 TCIRG1Q13488 830 aa16.43■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 USP44Q9H0E7 712 aa16.43■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.43■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.43■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 ZPR1O75312 459 aa16.42■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 PHF14O94880 888 aa16.42■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 IGKV5-2P06315 115 aa16.42■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 GCKRQ14397 625 aa16.41■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 HLFQ16534 295 aa16.41■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.41■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 CCDC191Q8NCU4 936 aa16.41■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 NUP98P52948 1817 aa16.4■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 GPTP24298 496 aa16.4■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 RFC4P35249 363 aa16.4■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 BAG6P46379 1132 aa16.4■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa16.4■□□□□ 0.22
CITED1-206ENST00000431381 HMMRO75330 724 aa16.39■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 CAMTA2O94983 1202 aa16.39■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa16.39■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.38■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 IGHDP01880 384 aa16.38■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 SMIM5Q71RC9 77 aa16.38■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 PROM2Q8N271 834 aa16.38■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.38■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 ISCA1Q9BUE6 129 aa16.38■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 BCORQ6W2J9 1755 aa16.37■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 ADRA2BP18089 450 aa16.37■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 CEP85Q6P2H3 762 aa16.37■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.37■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 NARFQ9UHQ1 456 aa16.37■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 MSH5O43196 834 aa16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 SSFA2P28290 1259 aa16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 SUCLG2Q96I99 432 aa16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
CITED1-206ENST00000431381 UTYO14607 1347 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms