RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430356.3

PITRM1-AS1-201, PITRM1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PITRM1-AS1, Length 3,998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.07□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.07□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 POLKQ9UBT6 870 aa10.07□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.07□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC66A2RUB6 948 aa10.07□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NECTIN2Q92692 538 aa10.07□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CKAP2LQ8IYA6 745 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ORAI2Q96SN7 254 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RTL1A6NKG5 1358 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GNAI2P04899 355 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ANAPC15P60006 121 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SYT1P21579 422 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CHMLP26374 656 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FERMT3Q86UX7 667 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KCND1Q9NSA2 647 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MIS18AQ9NYP9 233 aa10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 V9GYY5 206 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 F13A1P00488 732 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MAP3K11Q16584 847 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MCM10Q7L590 875 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 COG3Q96JB2 828 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 STK31Q9BXU1 1019 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NUP62CLQ9H1M0 184 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MSH6P52701 1360 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LRMPQ12912 555 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LUZP1Q86V48 1076 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.05□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FOXO3O43524 673 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TNMDQ9H2S6 317 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KCNF1Q9H3M0 494 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIAA0232Q92628 1395 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TCHHQ07283 1943 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SMTNL1A8MU46 457 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GJB2P29033 226 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BICD2Q8TD16 824 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CPA1P15085 419 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 AK2P54819 239 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.03□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KRT222Q8N1A0 295 aa10.02□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TMEM94Q12767 1356 aa10.02□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.8
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PEAK1Q9H792 1746 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCT4P50991 539 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KRT85P78386 507 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NRBP1Q9UHY1 535 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZNF853P0CG23 659 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NLRP6P59044 892 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CEP135Q66GS9 1140 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SPG7Q9UQ90 795 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.02□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 AP5Z1O43299 807 aa10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PSME1Q06323 249 aa10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TYRO3Q06418 890 aa10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BECN2A8MW95 431 aa10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABTB2Q8N961 1025 aa10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 USP6P35125 1406 aa10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PTPRCP08575 1304 aa10.01□□□□□ -0.81
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms