RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MASTLQ96GX5 879 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NFKBIEO00221 500 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RRAGCQ9HB90 399 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERBB4Q15303 1308 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RASSF7Q02833 373 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BCORQ6W2J9 1755 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C21orf2O43822 256 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NPR1P16066 1061 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRELPP51888 382 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ALDH1B1P30837 517 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NYXQ9GZU5 481 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERFEQ4G0M1 354 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RIPK4P57078 832 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HLFQ16534 295 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC93Q567U6 631 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CRY2Q49AN0 593 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLX4Q8IY92 1834 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.27■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WDR90Q96KV7 1748 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 POTECB2RU33 542 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PARP10Q53GL7 1025 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CEP350Q5VT06 3117 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYL6BP14649 208 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NGEFQ8N5V2 710 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KLRG1Q96E93 195 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 JMYQ8N9B5 988 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RUNDC1Q96C34 613 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CHL1O00533 1208 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PDIA6Q15084 440 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IFFO2Q5TF58 517 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PSMD1Q99460 953 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUP98P52948 1817 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FAM177BA6PVY3 158 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SUSD4Q5VX71 490 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HOXB7P09629 217 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NLRP3Q96P20 1036 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms