RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429747.5

CPNE4-201, Transcript of copine 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPNE4, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4-201ENST00000429747 FLT4P35916 1363 aa14.87□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 SERPINC1P01008 464 aa14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF853P0CG23 659 aa14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 PTPN14Q15678 1187 aa14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.86□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 CABP4P57796 275 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 SGSM2O43147 1006 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 BRF1Q92994 677 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 HYPKQ9NX55 129 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 EVA1CP58658 441 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 NEK1Q96PY6 1258 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 TPM1P09493 284 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 TYRO3Q06418 890 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 KIF2CQ99661 725 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.83□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 PTGS1P23219 599 aa14.83□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.83□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 LUZP1Q86V48 1076 aa14.83□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.83□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 FSIP1Q8NA03 581 aa14.83□□□□□ -0.03
CPNE4-201ENST00000429747 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.83□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 A0A087WZG4 1122 aa14.83□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 TSC1Q92574 1164 aa14.83□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 ANO10Q9NW15 660 aa14.83□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 TEX35Q5T0J7 233 aa14.83□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 BIN1O00499 593 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 RAD50Q92878 1312 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 GRM8O00222 908 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 USP44Q9H0E7 712 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 KIAA0232Q92628 1395 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 GOLIM4O00461 696 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 HSPA4P34932 840 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 VPS53Q5VIR6 699 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 TNRQ92752 1358 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 ERICH2A1L162 156 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 ATF3P18847 181 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 SLC39A6Q13433 755 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 KSR2Q6VAB6 950 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 JMYQ8N9B5 988 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 RUFY3Q7L099 469 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 MAP3K5Q99683 1374 aa14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 TET3O43151 1660 aa14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 HOXC9P31274 260 aa14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 KIF18AQ8NI77 898 aa14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 C8orf76Q96K31 380 aa14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 SNRKQ9NRH2 765 aa14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.8□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 CFAP100Q494V2 611 aa14.79□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 FAM227BQ96M60 508 aa14.79□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.79□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.79□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 LAMC1P11047 1609 aa14.79□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 ALDH1L1O75891 902 aa14.79□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 HAND2P61296 217 aa14.79□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 ISM2Q6H9L7 571 aa14.79□□□□□ -0.04
CPNE4-201ENST00000429747 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms