RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 SETDB2Q96T68 719 aa23.37■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.36■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 RGL2O15211 777 aa23.36■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 HLFQ16534 295 aa23.36■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.36■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.333e-6■■■□□ 18.6
HERC3-205ENST00000426683 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.36■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.36■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.35■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.35■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.35■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 A0A0G2JLW4 131 aa23.34■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.34■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.33■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 DPEP1P16444 411 aa23.33■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 COPS6Q7L5N1 327 aa23.32■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 TSPYL6Q8N831 410 aa23.32■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.32■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.32■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.32■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.31■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 NPHP1O15259 732 aa23.3■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.3■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 CNBD1Q8NA66 436 aa23.3■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.29■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 FAM177BA6PVY3 158 aa23.28■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 CHRNA5P30532 468 aa23.28■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 HYPKQ9NX55 129 aa23.28■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 ZNF521Q96K83 1311 aa23.28■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 ATP10DQ9P241 1426 aa23.27■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 KCNA3P22001 575 aa23.27■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 ST5P78524 1137 aa23.27■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 GOLGA2Q08379 1002 aa23.27■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.27■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.27■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.27■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HERC3-205ENST00000426683 GRIN3BO60391 1043 aa23.26■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 GPTP24298 496 aa23.26■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.26■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.26■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 PIM2Q9P1W9 311 aa23.25■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 BCS1LQ9Y276 419 aa23.25■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.24■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.24■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.24■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 PDE6BP35913 854 aa23.23■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.23■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.23■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 NUP98P52948 1817 aa23.22■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 H0YIN7 160 aa23.22■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.22■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 NYXQ9GZU5 481 aa23.22■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 SUSD4Q5VX71 490 aa23.21■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 STK31Q9BXU1 1019 aa23.21■■□□□ 1.31
HERC3-205ENST00000426683 TCIRG1Q13488 830 aa23.2■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 PARP10Q53GL7 1025 aa23.2■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.2■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 VAMP4O75379 141 aa23.19■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.19■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.18■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 ERFEQ4G0M1 354 aa23.18■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.18■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.18■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 E9PSI1 815 aa23.17■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 NTSR2O95665 410 aa23.17■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 YY1P25490 414 aa23.17■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 ABCC12Q96J65 1359 aa23.16■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 SLC4A2P04920 1241 aa23.16■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 NLRP10Q86W26 655 aa23.16■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 SRGNP10124 158 aa23.15■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 TTLL6Q8N841 843 aa23.15■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 UTRNP46939 3433 aa23.15■■□□□ 1.3
HERC3-205ENST00000426683 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.14■■□□□ 1.29
HERC3-205ENST00000426683 SLFN5Q08AF3 891 aa23.14■■□□□ 1.29
HERC3-205ENST00000426683 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.14■■□□□ 1.29
HERC3-205ENST00000426683 MASTLQ96GX5 879 aa23.14■■□□□ 1.29
HERC3-205ENST00000426683 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.14■■□□□ 1.29
HERC3-205ENST00000426683 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HERC3-205ENST00000426683 STYK1Q6J9G0 422 aa23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms