RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 AIDAQ96BJ3 306 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 TOP1P11387 765 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 NFE2L2Q16236 605 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 SSR1P43307 286 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 PIBF1Q8WXW3 757 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCF2Q9UG63 623 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF76P36508 570 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 PAFAH1B1P43034 410 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB11FIP3O75154 756 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 LUZP1Q86V48 1076 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS36Q86VN1 386 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 USP25Q9UHP3 1055 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CBX1P83916 185 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP15Q5T1M5 1219 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf76Q96K31 380 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEJP0CG39 1038 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC113Q9H0I3 377 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 BTBD11A6QL63 1104 aa12.77□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CTAGE5O15320 804 aa12.77□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 MCM3P25205 808 aa12.77□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 USP5P45974 858 aa12.77□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 TNNT1P13805 278 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CLIP2Q9UDT6 1046 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SPECC1Q5M775 1068 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 NEMFO60524 1076 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.373e-6■□□□□ 9.3
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC91Q7Z6B0 441 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 GIMAP7Q8NHV1 300 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 MYOM2P54296 1465 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 BOLA2Q9H3K6 86 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 NEBLO76041 1014 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL24Q5JXM2 366 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF287Q9HBT7 754 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 USO1O60763 962 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SSFA2P28290 1259 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 IFFO1Q0D2I5 559 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CKAP2LQ8IYA6 745 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 AKAP2Q9Y2D5 859 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 MYOM1P52179 1685 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 NAPBQ9H115 298 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CASQ1P31415 396 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 GSDMDP57764 484 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB34Q9BZG1 259 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 MINDY4BA8MYZ0 360 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM10Q9NQV6 1147 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRB1O14514 1584 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 GUCY1B3Q02153 619 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 MCM5P33992 734 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131 ms