RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.84■■□□□ 1.25
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.83■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.83■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.83■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.81■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNTROBQ8N137 903 aa22.81■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYD88Q99836 296 aa22.81■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL25Q9H293 177 aa22.81■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANAPC15P60006 121 aa22.8■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.8■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.8■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.8■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PALD1Q9ULE6 856 aa22.79■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAK2O60296 914 aa22.78■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL17RAQ96F46 866 aa22.78■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.78■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.78■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAPPAQ13219 1627 aa22.78■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL2RBP14784 551 aa22.77■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEK4P51957 841 aa22.77■■□□□ 1.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.77■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SASH1O94885 1247 aa22.77■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGSM2O43147 1006 aa22.76■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSFA2P28290 1259 aa22.76■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPATCH3Q96I76 525 aa22.76■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AACSQ86V21 672 aa22.75■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.75■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.75■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERBB4Q15303 1308 aa22.75■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL27Q8NEV9 243 aa22.74■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPA4P34932 840 aa22.73■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STRN4Q9NRL3 753 aa22.73■■□□□ 1.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAD50Q92878 1312 aa22.73■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCM2P49736 904 aa22.73■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.73■■□□□ 1.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL15A1P39059 1388 aa22.72■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBPF26B4DH59 902 aa22.72■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUCB2P80303 420 aa22.72■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBPF14Q5TI25 921 aa22.72■■□□□ 1.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBPF15Q8N660 670 aa22.72■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.71■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.71■■□□□ 1.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 EVA1CP58658 441 aa22.7■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.7■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMX3Q96JJ7 454 aa22.7■■□□□ 1.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.7■■□□□ 1.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.7■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.7■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNS2Q63HR2 1409 aa22.69■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTMSP20962 102 aa22.69■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.69■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EVI5LQ96CN4 794 aa22.69■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPRSQ9NQ92 184 aa22.69■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A087WZG4 1122 aa22.68■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASP7P55210 303 aa22.67■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKP1Q13835 747 aa22.67■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.67■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.67■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CUL4AQ13619 759 aa22.66■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TJP1Q07157 1748 aa22.65■■□□□ 1.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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