RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421164.5

AFG3L1P-204, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AFG3L1P, Length 1,706 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-204ENST00000421164 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.18■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 SLC15A2Q16348 729 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 HLFQ16534 295 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.16■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 CAMTA2O94983 1202 aa22.16■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.16■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.16■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 ABCC4O15439 1325 aa22.16■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 SSFA2P28290 1259 aa22.15■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.15■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.15■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 A0A087WZG4 1122 aa22.14■■□□□ 1.14
AFG3L1P-204ENST00000421164 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.14■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 STK32BQ9NY57 414 aa22.14■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.13■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 ADRA2BP18089 450 aa22.13■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 PDE3AQ14432 1141 aa22.13■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.13■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 NARFQ9UHQ1 456 aa22.13■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.12■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 RFC4P35249 363 aa22.12■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.12■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 BEND3Q5T5X7 828 aa22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 MYD88Q99836 296 aa22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 COG6Q9Y2V7 657 aa22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 IGKV5-2P06315 115 aa22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 ZPR1O75312 459 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 TCIRG1Q13488 830 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.08■■□□□ 1.13
AFG3L1P-204ENST00000421164 MSH5O43196 834 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 MS4A1P11836 297 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 CRBNQ96SW2 442 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 C4AP0C0L4 1744 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 GYS1P13807 737 aa22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 GPTP24298 496 aa22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 FKBP8Q14318 412 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 LINS1Q8NG48 757 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 ATP10DQ9P241 1426 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 BCORQ6W2J9 1755 aa22.04■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 SCN7AQ01118 1682 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 NLRP10Q86W26 655 aa22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 NUP98P52948 1817 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 RGL2O15211 777 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 ALDH1L1O75891 902 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 GCKRQ14397 625 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 USP44Q9H0E7 712 aa22.02■■□□□ 1.12
AFG3L1P-204ENST00000421164 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-204ENST00000421164 MEIS3Q99687 375 aa22.01■■□□□ 1.11
AFG3L1P-204ENST00000421164 MSL1Q68DK7 614 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-204ENST00000421164 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-204ENST00000421164 NFIXQ14938 502 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-204ENST00000421164 SUSD4Q5VX71 490 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-204ENST00000421164 DDX19BQ9UMR2 479 aa22■■□□□ 1.11
AFG3L1P-204ENST00000421164 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
AFG3L1P-204ENST00000421164 FAM177BA6PVY3 158 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms