RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 AK7Q96M32 723 aa21.44■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 RREB1Q92766 1687 aa21.44■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP10DQ9P241 1426 aa21.43■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.43■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.43■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.43■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNPATO15228 680 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.42■■□□□ 1.02
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TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL15A1P39059 1388 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 BEND3Q5T5X7 828 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINS1Q8NG48 757 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 EP400Q96L91 3159 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARXQ96QS3 562 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACNA1FO60840 1977 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGL2O15211 777 aa21.39■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALDH1L1O75891 902 aa21.39■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADRA2BP18089 450 aa21.39■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 C4BP0C0L5 1744 aa21.38■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSFA2P28290 1259 aa21.37■■□□□ 1.01
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.37■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYD88Q99836 296 aa21.37■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.37■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMTA2O94983 1202 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCIRG1Q13488 830 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKT1S1Q96B36 256 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.36■■□□□ 1.01
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 NARFQ9UHQ1 456 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.34■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNAI3P08754 354 aa21.34■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 RFC4P35249 363 aa21.33■■□□□ 1
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.33■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.33■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.33■■□□□ 1
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.33■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.33■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.32■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZPR1O75312 459 aa21.32■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 GCKRQ14397 625 aa21.32■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEIS3Q99687 375 aa21.32■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP44Q9H0E7 712 aa21.32■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.31■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHF14O94880 888 aa21.31■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF827Q17R98 1081 aa21.31■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.31■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.31■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 UTYO14607 1347 aa21.3■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRM8O00222 908 aa21.29■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.29■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 STK32BQ9NY57 414 aa21.29■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC15A2Q16348 729 aa21.28■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.28■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.28■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM5Q71RC9 77 aa21.28■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.27■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNAI2P04899 355 aa21.27■■□□□ 1
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARP10Q53GL7 1025 aa21.27■■□□□ 1
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP10Q86W26 655 aa21.26■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.26■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 H7C1W4 665 aa21.24■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPTP24298 496 aa21.24■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.24■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.24■□□□□ 0.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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