RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419593.5

SYS1-DBNDD2-201, Transcript of SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SYS1-DBNDD2, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SRGNP10124 158 aa22■■□□□ 1.11
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22■■□□□ 1.11
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TAOK3Q9H2K8 898 aa22■■□□□ 1.11
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.75■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.75■■□□□ 1.07
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 VEGFBP49765 207 aa21.75■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.75■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GPC2Q8N158 579 aa21.75■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SNED1Q8TER0 1413 aa21.74■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CNTROBQ8N137 903 aa21.74■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 JDP2Q8WYK2 163 aa21.74■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.73■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MYL6BP14649 208 aa21.73■■□□□ 1.07
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