RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.96■■□□□ 1.59
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PTPRJ-201ENST00000418331 SDSP20132 328 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-201ENST00000418331 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRJ-201ENST00000418331 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.95■■□□□ 1.59
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PTPRJ-201ENST00000418331 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.95■■□□□ 1.58
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PTPRJ-201ENST00000418331 USP16Q9Y5T5 823 aa24.92■■□□□ 1.58
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PTPRJ-201ENST00000418331 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.91■■□□□ 1.58
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PTPRJ-201ENST00000418331 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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PTPRJ-201ENST00000418331 SLF2Q8IX21 1173 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRJ-201ENST00000418331 CTAGE5O15320 804 aa24.9■■□□□ 1.58
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PTPRJ-201ENST00000418331 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRJ-201ENST00000418331 VAMP4O75379 141 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRJ-201ENST00000418331 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRJ-201ENST00000418331 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.89■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PP64 1363 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf229H3BNL8 230 aa24.88■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 NCOA7Q8NI08 942 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 FSIP1Q8NA03 581 aa24.88■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 TNNQ9UQP3 1299 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 NLRP5P59047 1200 aa24.87■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCC1P33527 1531 aa24.87■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 UQCRHP07919 91 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC96Q2M329 555 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 LDHCP07864 332 aa24.86■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 MICU3Q86XE3 530 aa24.86■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ERLIN1O75477 346 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 CNNM3Q8NE01 707 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 ZFYVE9O95405 1425 aa24.85■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.84■■□□□ 1.57
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PTPRJ-201ENST00000418331 LINS1Q8NG48 757 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 EYA1Q99502 592 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1328Q86T90 577 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 BRF1Q92994 677 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT24Q2M2I5 525 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 USP25Q9UHP3 1055 aa24.83■■□□□ 1.56
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