RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 POLA2Q14181 598 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 IL17RAQ96F46 866 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 HS1BP3Q53T59 392 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SGSM2O43147 1006 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 OFD1O75665 1012 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 COL18A1P39060 1754 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD50Q92878 1312 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTROBQ8N137 903 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 BEND3Q5T5X7 828 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 USP48Q86UV5 1035 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TPM2P07951 284 aa22.52■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.52■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 RASEFQ8IZ41 740 aa22.52■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SPG7Q9UQ90 795 aa22.52■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP27B1O15528 508 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PROSER3Q2NL68 480 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPY26PQ9H489 355 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TCHHQ07283 1943 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 AK2P54819 239 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CPA1P15085 419 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PHKG2P15735 406 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC14Q96N46 770 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 NCAPD2Q15021 1401 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PIP4K2BP78356 416 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 RUFY3Q7L099 469 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DTNBO60941 627 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCY9O60503 1353 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXB7P09629 217 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 EVA1CP58658 441 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF14O94880 888 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT1P21579 422 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 STX6O43752 255 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 LARGE1O95461 756 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 MYL6BP14649 208 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 PTH1RQ03431 593 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 BTG4Q9NY30 223 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS2O95450 1211 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CPDO75976 1380 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.4■■□□□ 1.18
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