RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.2■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 STAP2Q9UGK3 403 aa25.19■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.18■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 LRRC37A3O60309 1634 aa25.18■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 RASEFQ8IZ41 740 aa25.18■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 GRM8O00222 908 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 KAZALD1Q96I82 304 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 RAB11FIP3O75154 756 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 IGKV5-2P06315 115 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 CNTROBQ8N137 903 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 CYP27B1O15528 508 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 PDIA6Q15084 440 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 PHKG2P15735 406 aa25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 NUCB2P80303 420 aa25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 HOXB7P09629 217 aa25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.14■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 CHGBP05060 677 aa25.14■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 PTH1RQ03431 593 aa25.14■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 STRN4Q9NRL3 753 aa25.14■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 HYPKQ9NX55 129 aa25.14■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 KCNJ4P48050 445 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 FAM227BQ96M60 508 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 SASH1O94885 1247 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 LINS1Q8NG48 757 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 RGPD5Q99666 1765 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 SGSM2O43147 1006 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 CABP4P57796 275 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 MEGF6O75095 1541 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.08■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.08■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 ALDH1L1O75891 902 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 GPT2Q8TD30 523 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 HSPA4P34932 840 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 AK2P54819 239 aa25.06■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 LARGE1O95461 756 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 UQCRHP07919 91 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 GCKRQ14397 625 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 FSD1Q9BTV5 496 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 RAD50Q92878 1312 aa25.04■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 A0A087WZG4 1122 aa25.04■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 RNF214Q8ND24 703 aa25.04■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 A1BGP04217 495 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 A0A0G2JS52 829 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 CACNA1FO60840 1977 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 NECAB1Q8N987 351 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 OFD1O75665 1012 aa25.02■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
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