RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 ANXA1P04083 346 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 SSFA2P28290 1259 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 MEIS3Q99687 375 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 POLKQ9UBT6 870 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 IQCEQ6IPM2 695 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 NEK1Q96PY6 1258 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 SNRKQ9NRH2 765 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 GUCY1B3Q02153 619 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 14.7
SH3BP4-203ENST00000409212 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 C6orf229H3BNL8 230 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 BAG3O95817 575 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 USP16Q9Y5T5 823 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 FLT4P35916 1363 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 KSR2Q6VAB6 950 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 STX6O43752 255 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC96Q2M329 555 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 NCOA7Q8NI08 942 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 TESK2Q96S53 571 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF5BP33176 963 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 NLRP5P59047 1200 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.46■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 COPS6Q7L5N1 327 aa18.46■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 GJB2P29033 226 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP8B2P98198 1209 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 PDE4BQ07343 736 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 GRM8O00222 908 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 KIAA1328Q86T90 577 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 SDSP20132 328 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 PDE1AP54750 535 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 PAF1Q8N7H5 531 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 CUL5Q93034 780 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 TSG101Q99816 390 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF20AO95235 890 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 NPATQ14207 1427 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 FKBP15Q5T1M5 1219 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 KIAA0556O60303 1618 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 FSIP1Q8NA03 581 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 CNNM3Q8NE01 707 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 TAF4BQ92750 862 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 ZSCAN12O43309 604 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 RFC4P35249 363 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 PIK3C2GO75747 1445 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 H0YHG0 523 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 SKIDA1Q1XH10 827 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 LINS1Q8NG48 757 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFYVE9O95405 1425 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 MCM5P33992 734 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 IL15P40933 162 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPY2A6NKD2 308 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 ANAPC15P60006 121 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 DESP17661 470 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC66A2RUB6 948 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 HAND2P61296 217 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.543e-7■■■■□ 24.9
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP2B3Q16720 1220 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
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