RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.73■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa19.72■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFIXQ14938 502 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPYL6Q8N831 410 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NECTIN2Q92692 538 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.71■□□□□ 0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLFN5Q08AF3 891 aa19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PROSER3Q2NL68 480 aa19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STK31Q9BXU1 1019 aa19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAMB4A4D0S4 1761 aa19.69■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDR1Q08345 913 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTLL7Q6ZT98 887 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COPS6Q7L5N1 327 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SETDB2Q96T68 719 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYT17Q9BSW7 474 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.68■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VAMP4O75379 141 aa19.67■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANXA1P04083 346 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF428Q96B54 188 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP10DQ9P241 1426 aa19.66■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERPINB2P05120 415 aa19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB3Q9H5J0 574 aa19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C4AP0C0L4 1744 aa19.65■□□□□ 0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLFQ16534 295 aa19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.64■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TGFB2P61812 414 aa19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHL34Q8N239 644 aa19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP19.63■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCN7AQ01118 1682 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PARP10Q53GL7 1025 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF34Q8IZ26 560 aa19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNBD1Q8NA66 436 aa19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NYXQ9GZU5 481 aa19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCIRG1Q13488 830 aa19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.6■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPHP1O15259 732 aa19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST5P78524 1137 aa19.59■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.58■□□□□ 0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR5LQ6MZQ0 368 aa19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLGN2Q8NFZ4 835 aa19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.58■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLIIQ13045 1269 aa19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.57■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KSR2Q6VAB6 950 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPTP24298 496 aa19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE6BP35913 854 aa19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ISCA1Q9BUE6 129 aa19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUSD4Q5VX71 490 aa19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLRP10Q86W26 655 aa19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCORQ6W2J9 1755 aa19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NTSR2O95665 410 aa19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.53■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPEP1P16444 411 aa19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 G2E3Q7L622 706 aa19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.52■□□□□ 0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIC1Q4ADV7 1423 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0G2JLW4 131 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H0YIN7 160 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADCY9O60503 1353 aa19.5■□□□□ 0.71
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