RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 UBXN4Q92575 508 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 FAM177BA6PVY3 158 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 FSIP1Q8NA03 581 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 PLXNC1O60486 1568 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 CAVIN2O95810 425 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 NEK1Q96PY6 1258 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 RBSNQ9H1K0 784 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 WASF1Q92558 559 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 ANXA1P04083 346 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 PDE4CQ08493 712 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 IL13P35225 146 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 AK2P54819 239 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 GSDMDP57764 484 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF445P59923 1031 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 RAD21O60216 631 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 ERLIN1O75477 346 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-202ENST00000373779 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 MTMR7Q9Y216 660 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ATP10AO60312 1499 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ERVK-7P63135 1459 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ZSCAN12O43309 604 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 FOXO3O43524 673 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 STRN4Q9NRL3 753 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ABCA8O94911 1581 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TDO2P48775 406 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 A0A087WZG4 1122 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ZMYND15Q9H091 742 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 FLT4P35916 1363 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 AIDAQ96BJ3 306 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ALDH1L1O75891 902 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 DACT1Q9NYF0 836 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 GOLIM4O00461 696 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 METTL24Q5JXM2 366 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 CEP135Q66GS9 1140 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ERICH4A6NGS2 130 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 G2E3Q7L622 706 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 STIM1Q13586 685 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TMC6Q7Z403 805 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 BRF1Q92994 677 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ABCC4O15439 1325 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TAF3Q5VWG9 929 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TNRQ92752 1358 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF213O14771 459 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 EPS15P42566 896 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 TRPM2O94759 1503 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRU-202ENST00000373779 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRU-202ENST00000373779 BIN1O00499 593 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms