RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 CNBD1Q8NA66 436 aa18.06■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 BTBD11A6QL63 1104 aa18.05■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.05■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.04■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.04■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 NPHP1O15259 732 aa18.04■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 STYK1Q6J9G0 422 aa18.04■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 CNKSR1Q969H4 720 aa18.04■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 CHADLQ6NUI6 762 aa18.03■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 MASTLQ96GX5 879 aa18.03■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 BCORQ6W2J9 1755 aa18.03■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 PRKAR2BP31323 418 aa18.02■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 ST5P78524 1137 aa18.02■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 OLFM4Q6UX06 510 aa18.02■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.02■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.02■□□□□ 0.48
TTPAL-203ENST00000372906 CREBZFQ9NS37 354 aa18.01■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.01■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 MCM10Q7L590 875 aa18■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 FAM177BA6PVY3 158 aa17.98■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 NBPF26B4DH59 902 aa17.98■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 DCTN1Q14203 1278 aa17.98■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 NBPF15Q8N660 670 aa17.98■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 SOGA3Q5TF21 947 aa17.97■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 CLEC4GQ6UXB4 293 aa17.97■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 PASKQ96RG2 1323 aa17.97■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF541Q9H0D2 1346 aa17.97■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 NPR1P16066 1061 aa17.96■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 HLFQ16534 295 aa17.96■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC93Q567U6 631 aa17.96■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
TTPAL-203ENST00000372906 FOXN1O15353 648 aa17.95■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 LDHDQ86WU2 507 aa17.95■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 MIS18AQ9NYP9 233 aa17.95■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 SCN4AP35499 1836 aa17.95■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 CNTNAP1P78357 1384 aa17.94■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 IQCA1LA6NCM1 817 aa17.94■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 TPTE2Q6XPS3 522 aa17.94■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 VEGFBP49765 207 aa17.93■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 CFAP53Q96M91 514 aa17.93■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF652Q9Y2D9 606 aa17.93■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 SYNE4Q8N205 404 aa17.91■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 NGEFQ8N5V2 710 aa17.91■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 CLEC11AQ9Y240 323 aa17.91■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM88BA6NKF7 163 aa17.9■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 PPP2R1AP30153 589 aa17.9■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 EPHX2P34913 555 aa17.9■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 SLC51AQ86UW1 340 aa17.9■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 RTKN2Q8IZC4 609 aa17.9■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 HACL1Q9UJ83 578 aa17.9■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 NUDCQ9Y266 331 aa17.9■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 RNF123Q5XPI4 1314 aa17.9■□□□□ 0.46
TTPAL-203ENST00000372906 FZD9O00144 591 aa17.89■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 IARSP41252 1262 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 NUTM1Q86Y26 1132 aa17.89■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa17.89■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 COL4A5P29400 1685 aa17.87■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 NUP98P52948 1817 aa17.87■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 ALDH1B1P30837 517 aa17.87■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 CNTROBQ8N137 903 aa17.87■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 ABCC12Q96J65 1359 aa17.87■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 SNED1Q8TER0 1413 aa17.87■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 RGL2O15211 777 aa17.86■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 TTLL7Q6ZT98 887 aa17.86■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 CRY2Q49AN0 593 aa17.85■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.85■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 WBP1LQ9NX94 342 aa17.85■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.84■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 GPTP24298 496 aa17.84■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 LBX1P52954 281 aa17.84■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 GPC2Q8N158 579 aa17.84■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 PSMD1Q99460 953 aa17.84■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.84■□□□□ 0.45
TTPAL-203ENST00000372906 LTBP1Q14766 1721 aa17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms