RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 SKILP12757 684 aa25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 SARM1Q6SZW1 724 aa25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.72■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.72■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.72■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 ST3GAL1Q11201 340 aa25.72■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.72■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.72■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.72■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.72■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 F6X3S4 739 aa25.71■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CPA1P15085 419 aa25.71■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 GTF3C6Q969F1 213 aa25.71■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.71■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 L2HGDHQ9H9P8 463 aa25.71■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CCZ1BP86790 482 aa25.7■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 PLA2G4AP47712 749 aa25.7■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 CAVIN2O95810 425 aa25.69■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 CLCN6P51797 869 aa25.69■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 ATP8B2P98198 1209 aa25.69■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.69■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.69■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.69■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.69■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 VPS53Q5VIR6 699 aa25.68■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 G2E3Q7L622 706 aa25.68■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 PRAM1Q96QH2 718 aa25.68■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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OPN3-201ENST00000366554 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.68■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 NPHP1O15259 732 aa25.67■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 IQCB1Q15051 598 aa25.67■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.67■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.67■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.67■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 CDK19Q9BWU1 502 aa25.67■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 CCDC69A6NI79 296 aa25.66■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 PIK3C2BO00750 1634 aa25.66■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 FERMT3Q86UX7 667 aa25.66■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 NR1I2O75469 434 aa25.65■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 ME3Q16798 604 aa25.65■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 CCDC93Q567U6 631 aa25.65■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.65■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.65■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.64■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.64■■□□□ 1.7
OPN3-201ENST00000366554 EFCC1Q9HA90 598 aa25.64■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 USP16Q9Y5T5 823 aa25.64■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.63■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.63■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 SPATA32Q96LK8 384 aa25.63■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 GNAI3P08754 354 aa25.62■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.62■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 TEX35Q5T0J7 233 aa25.62■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.62■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.62■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.62■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.62■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 NEK11Q8NG66 645 aa25.62■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.61■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 NECAB1Q8N987 351 aa25.61■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 SPG7Q9UQ90 795 aa25.61■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.61■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 MCM10Q7L590 875 aa25.61■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.6■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 PGBD1Q96JS3 809 aa25.6■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.6■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.59■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 CERS3Q8IU89 383 aa25.59■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.59■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.59■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 PDCP20941 246 aa25.59■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 TPM4P67936 248 aa25.59■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 KCNB2Q92953 911 aa25.59■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 RASSF4Q9H2L5 321 aa25.58■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.58■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.58■■□□□ 1.69
OPN3-201ENST00000366554 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
OPN3-201ENST00000366554 ATP7BP35670 1465 aa25.57■■□□□ 1.68
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