RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362390.1

RNU6-874P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 874, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-874P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-874P-201ENST00000362390 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 SLC30A3Q99726 388 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 PRDM6Q9NQX0 595 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 VAC14Q08AM6 782 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 MAP7D1Q3KQU3 841 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 TNFRSF25Q93038 417 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 NACC1Q96RE7 527 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-874P-201ENST00000362390 ADH7P40394 386 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 LRP8Q14114 963 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 EML1O00423 815 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 SELPP16109 830 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 MBTPS1Q14703 1052 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 SPEM2Q0P670 501 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 ADGRE1Q14246 886 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 TEAD4Q15561 434 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 C9orf172C9J069 976 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 PIK3CDO00329 1044 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 BACH1O14867 736 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 NOS2P35228 1153 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 TBCELQ5QJ74 424 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 A0A0A0MRY4 1105 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 ELNP15502 786 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 EPHA4P54764 986 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 ZNF358Q9NW07 568 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 LILRB5O75023 590 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 SEMA3FQ13275 785 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 NEUROD1Q13562 356 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 GDPD2Q9HCC8 539 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 BRD7Q9NPI1 651 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-874P-201ENST00000362390 BTBD11A6QL63 1104 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 ABL2P42684 1182 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 GTF2IP78347 998 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 TNS4Q8IZW8 715 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 TP53INP1Q96A56 240 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 SERTM1A2A2V5 107 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 KCNQ4P56696 695 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 PSME1Q06323 249 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 EML3Q32P44 896 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 CEP63Q96MT8 703 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 NOD1Q9Y239 953 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 TYRO3Q06418 890 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 WASHC4Q2M389 1173 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 ZNF280CQ8ND82 737 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 NUDT8Q8WV74 236 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 BHMTQ93088 406 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 SFI1A8K8P3 1242 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 RAC1P63000 192 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 USP21Q9UK80 565 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 SKIP12755 728 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 SOX11P35716 441 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 NCOA4Q13772 614 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 ILDR2Q71H61 639 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 IGFLR1Q9H665 355 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 NAGPAQ9UK23 515 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 SUSD3Q96L08 255 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-874P-201ENST00000362390 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms