RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD62A6NC57 917 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ANAPC15P60006 121 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 KIF4AO95239 1232 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PTPN14Q15678 1187 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC45Q96CN5 670 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 STK3Q13188 491 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CENPHQ9H3R5 247 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 SPC24Q8NBT2 197 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CALML4Q96GE6 196 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PBRM1Q86U86 1689 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 BCAR3O75815 825 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 HLA-DOAP06340 250 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PPM1EQ8WY54 764 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 B4DLN1 442 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 TMTC2Q8N394 836 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC102AQ96A19 550 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 UQCRHP07919 91 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 KRT23Q9C075 422 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PLXNC1O60486 1568 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PAFAH1B1P43034 410 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 SPAG1Q07617 926 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 UVSSAQ2YD98 709 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CERS3Q8IU89 383 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA0556O60303 1618 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ACTN2P35609 894 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 TRPM2O94759 1503 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 RARSP54136 660 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF213O14771 459 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 SYCE3A1L190 88 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CASQ1P31415 396 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 KIF1BO60333 1816 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 MYO1BO43795 1136 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 FLIIQ13045 1269 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ADAMTS12P58397 1594 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 GNAQP50148 359 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 GNAT2P19087 354 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 NCOA7Q8NI08 942 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 SCLT1Q96NL6 688 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2HP62256 183 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 RTL9Q8NET4 1388 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-201ENST00000356100 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.92□□□□□ -1.3
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