RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 PLBD2Q8NHP8 589 aa35.36■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa35.35■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 RFC4P35249 363 aa35.35■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 KSR2Q6VAB6 950 aa35.35■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa35.35■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 C4AP0C0L4 1744 aa35.34■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 SMIM5Q71RC9 77 aa35.34■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 RIC3Q7Z5B4 369 aa35.34■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 PI4KAP2A4QPH2 592 aa35.33■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa35.33■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 ERVV-1B6SEH8 477 aa35.33■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 RRP1P56182 461 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 NARFQ9UHQ1 456 aa35.33■■■■□ 3.25
GIPC1-201ENST00000345425 ZPR1O75312 459 aa35.32■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB3Q9H5J0 574 aa35.32■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 ADCY9O60503 1353 aa35.32■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa35.31■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM27P14373 513 aa35.3■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa35.3■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 BCORQ6W2J9 1755 aa35.3■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa35.3■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 CAMTA2O94983 1202 aa35.3■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 SCN7AQ01118 1682 aa35.29■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 RNF123Q5XPI4 1314 aa35.29■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 RGL2O15211 777 aa35.29■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 PLIN1O60240 522 aa35.29■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 MS4A1P11836 297 aa35.29■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 DNAAF4Q8WXU2 420 aa35.29■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.28■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 F6X3S4 739 aa35.28■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
GIPC1-201ENST00000345425 MSH5O43196 834 aa35.25■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 USPL1Q5W0Q7 1092 aa35.25■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC4GQ6UXB4 293 aa35.25■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 PXDNLA1KZ92 1463 aa35.25■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa35.25■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 NUP98P52948 1817 aa35.24■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 NEXNQ0ZGT2 675 aa35.24■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 CLUAP1Q96AJ1 413 aa35.24■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 ABCC4O15439 1325 aa35.24■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 SOCS7O14512 581 aa35.23■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 HLFQ16534 295 aa35.23■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 SLC4A10Q6U841 1118 aa35.23■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 PDE3AQ14432 1141 aa35.22■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 TNNQ9UQP3 1299 aa35.21■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 TCIRG1Q13488 830 aa35.2■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 MYD88Q99836 296 aa35.2■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 ATP10DQ9P241 1426 aa35.2■■■■□ 3.23
GIPC1-201ENST00000345425 BCL2L12Q9HB09 334 aa35.19■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa35.19■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 GYS1P13807 737 aa35.18■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 CCT4P50991 539 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 LINS1Q8NG48 757 aa35.18■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 BEND3Q5T5X7 828 aa35.17■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa35.17■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 RLBP1P12271 317 aa35.15■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 PANK1Q8TE04 598 aa35.15■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM57Q8N5G2 664 aa35.14■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 SLC16A10Q8TF71 515 aa35.14■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 ISCA1Q9BUE6 129 aa35.14■■■■□ 3.22
GIPC1-201ENST00000345425 ALDH1L1O75891 902 aa35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 FKBP8Q14318 412 aa35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 C20orf194Q5TEA3 1177 aa35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF34Q8IZ26 560 aa35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 NLGN1Q8N2Q7 840 aa35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV5-2P06315 115 aa35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP35.13■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 NEURL1BA8MQ27 555 aa35.11■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 GPTP24298 496 aa35.11■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D9BQ66K14 1250 aa35.11■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC191Q8NCU4 936 aa35.11■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 ITPRIPQ8IWB1 547 aa35.1■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 PARP10Q53GL7 1025 aa35.1■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 SETDB2Q96T68 719 aa35.1■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 CASZ1Q86V15 1759 aa35.09■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 BICDL1Q6ZP65 573 aa35.08■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 MVPQ14764 893 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 NLRP10Q86W26 655 aa35.08■■■■□ 3.21
GIPC1-201ENST00000345425 UBN2Q6ZU65 1347 aa35.07■■■■□ 3.2
GIPC1-201ENST00000345425 COG6Q9Y2V7 657 aa35.07■■■■□ 3.2
GIPC1-201ENST00000345425 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
GIPC1-201ENST00000345425 NFIXQ14938 502 aa35.06■■■■□ 3.2
GIPC1-201ENST00000345425 GCKRQ14397 625 aa35.05■■■■□ 3.2
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