RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 USP48Q86UV5 1035 aa27.17■■□□□ 1.94
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HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 RRP9O43818 475 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 KSR2Q6VAB6 950 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 GPATCH3Q96I76 525 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD1-201ENST00000331462 UTYO14607 1347 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 ANXA1P04083 346 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 VPS53Q5VIR6 699 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 HYPKQ9NX55 129 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 STX6O43752 255 aa27.11■■□□□ 1.93
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HOXD1-201ENST00000331462 SYT1P21579 422 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 PSME1Q06323 249 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 EVI5LQ96CN4 794 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 UVSSAQ2YD98 709 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC183Q5T5S1 534 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 SNRKQ9NRH2 765 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 F13A1P00488 732 aa27.09■■□□□ 1.93
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HOXD1-201ENST00000331462 UBE2HP62256 183 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 RNF214Q8ND24 703 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 LINS1Q8NG48 757 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD1-201ENST00000331462 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 PTH1RQ03431 593 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 PROSER3Q2NL68 480 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 TCHHQ07283 1943 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 MRC1P22897 1456 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 NECTIN1Q15223 517 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 CNPY2Q9Y2B0 182 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC171Q6TFL3 1326 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 HIP1O00291 1037 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 GCP02774 474 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 GRM8O00222 908 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.05■■□□□ 1.92
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HOXD1-201ENST00000331462 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 KAZALD1Q96I82 304 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 AACSQ86V21 672 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 ADCK5Q3MIX3 580 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 MTMR6Q9Y217 621 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 SUCLG2Q96I99 432 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD1-201ENST00000331462 SASH1O94885 1247 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 CPA1P15085 419 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 MAP4K1Q92918 833 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 JCADQ9P266 1359 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 MST1RQ04912 1400 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 GJB2P29033 226 aa27■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 ST3GAL1Q11201 340 aa27■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC83Q8IWF9 413 aa27■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 PDIA6Q15084 440 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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