RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309027.4

GOLIM4-201, Transcript of golgi integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GOLIM4, Length 2,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4-201ENST00000309027 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 FKBP8Q14318 412 aa20.06■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 MSL1Q68DK7 614 aa20.06■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.06■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.05■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 PTGER2P43116 358 aa20.05■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.05■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 C4AP0C0L4 1744 aa20.04■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 POLD1P28340 1107 aa20.04■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 TM4SF1P30408 202 aa20.04■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.04■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.03■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 HLFQ16534 295 aa20.03■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.03■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.02■□□□□ 0.8
GOLIM4-201ENST00000309027 MMP10P09238 476 aa20.02■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 FLIIQ13045 1269 aa20.01■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 NFIXQ14938 502 aa20.01■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.01■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 G2E3Q7L622 706 aa20.01■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 RARSP54136 660 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 SETDB2Q96T68 719 aa19.99■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.99■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 KSR2Q6VAB6 950 aa19.99■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.99■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 SCN7AQ01118 1682 aa19.99■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 DDR1Q08345 913 aa19.98■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 TCIRG1Q13488 830 aa19.98■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.98■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.98■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.98■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 ATP10DQ9P241 1426 aa19.98■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 ZNF34Q8IZ26 560 aa19.97■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.96■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.96■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 BCORQ6W2J9 1755 aa19.96■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.96■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 SERPINB2P05120 415 aa19.96■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.96■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.96■□□□□ 0.79
GOLIM4-201ENST00000309027 PTPRCP08575 1304 aa19.95■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 ADCY9O60503 1353 aa19.95■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 PARP10Q53GL7 1025 aa19.94■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 ISCA1Q9BUE6 129 aa19.94■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 LRP5O75197 1615 aa19.93■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 GPTP24298 496 aa19.93■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.92■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.92■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 NLRP10Q86W26 655 aa19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 MYD88Q99836 296 aa19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 NYXQ9GZU5 481 aa19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 BCAR3O75815 825 aa19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 SUSD4Q5VX71 490 aa19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 KIF16BQ96L93 1317 aa19.91■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 ARHGAP45Q92619 1136 aa19.9■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.9■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.9■□□□□ 0.78
GOLIM4-201ENST00000309027 F6X3S4 739 aa19.89■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 CACNA1FO60840 1977 aa19.89■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 PRR5LQ6MZQ0 368 aa19.89■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 CNBD1Q8NA66 436 aa19.89■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.89■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.88■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 NTSR2O95665 410 aa19.88■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 IGKV5-2P06315 115 aa19.88■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 LINS1Q8NG48 757 aa19.88■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.88■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 FAM177BA6PVY3 158 aa19.87■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 NPHP1O15259 732 aa19.87■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 ST5P78524 1137 aa19.87■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 NUP98P52948 1817 aa19.87■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 BEND3Q5T5X7 828 aa19.87■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.86■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.86■□□□□ 0.77
GOLIM4-201ENST00000309027 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms