RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VPS53Q5VIR6 699 aa26.9■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEMFO60524 1076 aa26.9■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF592Q92610 1267 aa26.9■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COG3Q96JB2 828 aa26.9■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.89■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CRB1P82279 1406 aa26.89■■□□□ 1.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC144BQ3MJ40 725 aa26.89■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.89■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.89■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.88■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.88■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.88■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAPN2P17655 700 aa26.87■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF20Q5VTR2 975 aa26.87■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DACT1Q9NYF0 836 aa26.87■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.87■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERBB3P21860 1342 aa26.87■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.87■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSPYL1Q9H0U9 437 aa26.87■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPN14Q15678 1187 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC8AQ8IWT6 810 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAVIN2O95810 425 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP2C19P33261 490 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNTROBQ8N137 903 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALKQ9UM73 1620 aa26.86■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAB11FIP3O75154 756 aa26.85■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CPA1P15085 419 aa26.85■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF165P49910 485 aa26.85■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCND1Q9NSA2 647 aa26.85■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ELF2Q15723 593 aa26.85■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SARM1Q6SZW1 724 aa26.85■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.84■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERICH4A6NGS2 130 aa26.84■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF446Q9NWS9 450 aa26.84■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DLC1Q96QB1 1528 aa26.84■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.84■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.84■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP27XA6NNY8 438 aa26.83■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLU7O95391 586 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ST3GAL1Q11201 340 aa26.83■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.83■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STK31Q9BXU1 1019 aa26.83■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.83■■□□□ 1.89
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDCP20941 246 aa26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ST7Q9NRC1 585 aa26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 V9GYY5 206 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.81■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.81■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SSH3Q8TE77 659 aa26.81■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ME3Q16798 604 aa26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNB2Q92953 911 aa26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPG7Q9UQ90 795 aa26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPATA32Q96LK8 384 aa26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FLIIQ13045 1269 aa26.79■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.79■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.78■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DTNBO60941 627 aa26.78■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SKILP12757 684 aa26.78■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.78■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FERMT3Q86UX7 667 aa26.78■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NECAB1Q8N987 351 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CPS1P31327 1500 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITSN1Q15811 1721 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCZ1BP86790 482 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms