RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.68■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 IL16Q14005 1332 aa23.68■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 SETDB2Q96T68 719 aa23.67■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 ADCY9O60503 1353 aa23.67■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.66■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 RGL2O15211 777 aa23.65■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.65■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 CHL1O00533 1208 aa23.64■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.64■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.64■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.63■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 ATP10DQ9P241 1426 aa23.63■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 E9PSI1 815 aa23.63■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 SLFN5Q08AF3 891 aa23.63■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.63■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 HLFQ16534 295 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 CNBD1Q8NA66 436 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 ERBB4Q15303 1308 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.61■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 MYL6BP14649 208 aa23.61■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 IFT57Q9NWB7 429 aa23.61■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.61■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 H0YIN7 160 aa23.6■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 ZNF853P0CG23 659 aa23.6■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.6■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 PDIA6Q15084 440 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 CFAP44Q96MT7 982 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 PDE6BP35913 854 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 GNAI1P63096 354 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 KRT24Q2M2I5 525 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 TTLL6Q8N841 843 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.58■■□□□ 1.37
PTX4-201ENST00000293922 ST5P78524 1137 aa23.58■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.58■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.58■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 NPHP1O15259 732 aa23.57■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 PROSER3Q2NL68 480 aa23.56■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.56■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.55■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 ANXA1P04083 346 aa23.54■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.54■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.53■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 NECTIN2Q92692 538 aa23.53■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 MBIPQ9NS73 344 aa23.53■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 FAM177BA6PVY3 158 aa23.52■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 SRGNP10124 158 aa23.52■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.52■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTX4-201ENST00000293922 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 NUP98P52948 1817 aa23.51■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 HOXB7P09629 217 aa23.5■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.5■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 STYK1Q6J9G0 422 aa23.5■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 GPTP24298 496 aa23.49■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 C1QTNF8P60827 252 aa23.49■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 RASSF7Q02833 373 aa23.49■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.49■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 MASTLQ96GX5 879 aa23.49■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.48■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 COPS6Q7L5N1 327 aa23.48■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 NYXQ9GZU5 481 aa23.48■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 RNF181Q9P0P0 153 aa23.48■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.48■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 ABCC12Q96J65 1359 aa23.47■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 NFKBIEO00221 500 aa23.47■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.47■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.47■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 CNKSR1Q969H4 720 aa23.47■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 C21orf2O43822 256 aa23.46■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 PRELPP51888 382 aa23.46■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 SUSD4Q5VX71 490 aa23.46■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTX4-201ENST00000293922 NPR1P16066 1061 aa23.45■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 SBF1O95248 1867 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 NTSR2O95665 410 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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