RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 PDCP20941 246 aa18.12■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.12■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 PTPN14Q15678 1187 aa18.11■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.11■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 ATP8B2P98198 1209 aa18.11■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 PIK3C2BO00750 1634 aa18.11■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 DMTNQ08495 405 aa18.1■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.1■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 TMX1Q9H3N1 280 aa18.1■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 ZFYVE9O95405 1425 aa18.1■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 KINO60870 393 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 CHL1O00533 1208 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 ME1P48163 572 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 LIG1P18858 919 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 REREQ9P2R6 1566 aa18.09■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 ZNF853P0CG23 659 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 PSMA5P28066 241 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 ADGRB1O14514 1584 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 LARGE1O95461 756 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 CUL4AQ13619 759 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 CEP135Q66GS9 1140 aa18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
USP25-201ENST00000285679 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 RUFY3Q7L099 469 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 MYOM1P52179 1685 aa18.08■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 A0A087WWV3 80 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 VGLL3A8MV65 326 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 PTCH1Q13635 1447 aa18.07■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 ISM2Q6H9L7 571 aa18.06■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.06■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.06■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 MNS1Q8NEH6 495 aa18.06■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 HSPA4P34932 840 aa18.06■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 IL25Q9H293 177 aa18.06■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 BIN1O00499 593 aa18.05■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.05■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 KIAA1524Q8TCG1 905 aa18.05■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.05■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 CBX8Q9HC52 389 aa18.05■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 SKILP12757 684 aa18.05■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.05■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 SGSM2O43147 1006 aa18.05■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 USP16Q9Y5T5 823 aa18.04■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.04■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 CCDC66A2RUB6 948 aa18.04■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.04■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 TPM4P67936 248 aa18.04■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.04■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 TTC6Q86TZ1 520 aa18.04■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 PTH1RQ03431 593 aa18.03■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.02■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 MTMR6Q9Y217 621 aa18.02■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.02■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 RAD50Q92878 1312 aa18.02■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.02■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.02■□□□□ 0.48
USP25-201ENST00000285679 ME3Q16798 604 aa18.02■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.02■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 KIF18AQ8NI77 898 aa18.01■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.01■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.01■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 FAM227BQ96M60 508 aa18.01■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 PDILTQ8N807 584 aa18.01■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 GTF3C6Q969F1 213 aa18.01■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 ACEP12821 1306 aa18.01■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 RGS12O14924 1447 aa18■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 KIF20AO95235 890 aa18■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa18■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 SMTNL1A8MU46 457 aa18■□□□□ 0.47
USP25-201ENST00000285679 ATP2B1P20020 1258 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.5 ms