RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CADPS2Q86UW7 1296 aa33.78■■■■□ 3
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UBP1-201ENST00000283628 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.77■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 ERC1Q8IUD2 1116 aa33.76■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
UBP1-201ENST00000283628 RNMTO43148 476 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
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UBP1-201ENST00000283628 PHF14O94880 888 aa33.75■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.75■■■□□ 2.99
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UBP1-201ENST00000283628 STRCQ7RTU9 1775 aa33.75■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 TMEM87AQ8NBN3 555 aa33.75■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 GPATCH3Q96I76 525 aa33.75■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa33.74■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa33.74■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.73■■■□□ 2.99
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UBP1-201ENST00000283628 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 KSR2Q6VAB6 950 aa33.73■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.73■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa33.73■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 ECHDC1Q9NTX5 307 aa33.72■■■□□ 2.99
UBP1-201ENST00000283628 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
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UBP1-201ENST00000283628 TSPY26PQ9H489 355 aa33.71■■■□□ 2.99
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UBP1-201ENST00000283628 USP48Q86UV5 1035 aa33.68■■■□□ 2.98
UBP1-201ENST00000283628 HYPKQ9NX55 129 aa33.68■■■□□ 2.98
UBP1-201ENST00000283628 AXIN2Q9Y2T1 843 aa33.68■■■□□ 2.98
UBP1-201ENST00000283628 MCM5P33992 734 aa33.68■■■□□ 2.98
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
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UBP1-201ENST00000283628 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.66■■■□□ 2.98
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UBP1-201ENST00000283628 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
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UBP1-201ENST00000283628 KLHL34Q8N239 644 aa33.62■■■□□ 2.97
UBP1-201ENST00000283628 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa33.62■■■□□ 2.97
UBP1-201ENST00000283628 HIP1O00291 1037 aa33.62■■■□□ 2.97
UBP1-201ENST00000283628 FAM184AQ8NB25 1140 aa33.62■■■□□ 2.97
UBP1-201ENST00000283628 GDPD2Q9HCC8 539 aa33.62■■■□□ 2.97
UBP1-201ENST00000283628 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
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UBP1-201ENST00000283628 SYT1P21579 422 aa33.61■■■□□ 2.97
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UBP1-201ENST00000283628 RNF214Q8ND24 703 aa33.59■■■□□ 2.97
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UBP1-201ENST00000283628 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.97
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