RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 C1QTNF8P60827 252 aa27.26■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 DDR1Q08345 913 aa27.25■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 NUP98P52948 1817 aa27.25■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.24■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.23■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 TM4SF1P30408 202 aa27.23■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 TGFB2P61812 414 aa27.23■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 NFIXQ14938 502 aa27.23■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.23■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.23■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.22■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.21■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.21■■□□□ 1.95
COX5B-201ENST00000258424 GOLGA2Q08379 1002 aa27.2■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 HLFQ16534 295 aa27.19■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.19■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.19■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.18■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.18■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 A0A0G2JLW4 131 aa27.18■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.17■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.17■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.17■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.17■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.16■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 COPS6Q7L5N1 327 aa27.16■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.16■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 SLFN5Q08AF3 891 aa27.15■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 ATP10DQ9P241 1426 aa27.15■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.14■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 E9PSI1 815 aa27.14■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 RGL2O15211 777 aa27.14■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 BCS1LQ9Y276 419 aa27.14■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.14■■□□□ 1.94
COX5B-201ENST00000258424 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 VAMP4O75379 141 aa27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 SERPINB2P05120 415 aa27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 DPEP1P16444 411 aa27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.13■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 HYPKQ9NX55 129 aa27.12■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.12■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 CACNA1FO60840 1977 aa27.11■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 SETDB2Q96T68 719 aa27.1■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 ADCY9O60503 1353 aa27.09■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
COX5B-201ENST00000258424 KCNA3P22001 575 aa27.07■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.07■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.07■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.07■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 GPTP24298 496 aa27.06■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.06■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 STK31Q9BXU1 1019 aa27.06■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.05■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.05■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.05■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 PIM2Q9P1W9 311 aa27.05■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.04■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 G2E3Q7L622 706 aa27.04■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 FAM177BA6PVY3 158 aa27.03■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 SLC4A2P04920 1241 aa27.03■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 CNBD1Q8NA66 436 aa27.03■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.03■■□□□ 1.92
COX5B-201ENST00000258424 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 TCIRG1Q13488 830 aa27■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.99■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 CHRNA5P30532 468 aa26.99■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.99■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 SUSD4Q5VX71 490 aa26.99■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 ABCC12Q96J65 1359 aa26.98■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.98■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 NPHP1O15259 732 aa26.97■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 NTSR2O95665 410 aa26.97■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 FLIIQ13045 1269 aa26.97■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 ST5P78524 1137 aa26.96■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 PARP10Q53GL7 1025 aa26.96■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.96■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 NLRP10Q86W26 655 aa26.96■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.96■■□□□ 1.91
COX5B-201ENST00000258424 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.96■■□□□ 1.91
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