RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 ZNF445P59923 1031 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 ABCC11Q96J66 1382 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 CCDC6Q16204 474 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 CFTRP13569 1480 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 FBF1Q8TES7 1133 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 NFE2L2Q16236 605 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 CTAGE9A4FU28 777 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 SEC24BO95487 1268 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 FAM76AQ8TAV0 307 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 CEP63Q96MT8 703 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 C6orf163Q5TEZ5 329 aa18.47■□□□□ 0.55
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CTIF-201ENST00000256413 ISM2Q6H9L7 571 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 F13A1P00488 732 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 ANKS4BQ8N8V4 417 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 POTEDQ86YR6 584 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 MAP2K2P36507 400 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 KIF5BP33176 963 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 PSME1Q06323 249 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 VPS36Q86VN1 386 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 BANK1Q8NDB2 785 aa18.45■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 ELF2Q15723 593 aa18.45■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 ZEB2O60315 1214 aa18.45■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CEP83Q9Y592 693 aa18.45■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.549e-7■■□□□ 13.7
CTIF-201ENST00000256413 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.45■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 INPP5BP32019 993 aa18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 ANAPC15P60006 121 aa18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CCDC102BQ68D86 513 aa18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 AFAP1L1Q8TED9 768 aa18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 SPG7Q9UQ90 795 aa18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.43■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.43■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 RHOXF2BP0C7M4 288 aa18.43■□□□□ 0.54
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CTIF-201ENST00000256413 RHOXF2Q9BQY4 288 aa18.43■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 SDSP20132 328 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CETN2P41208 172 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 SOGA3Q5TF21 947 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB9Q96C00 473 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 TMCO5BA8MYB1 307 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 N4BP3O15049 544 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN26Q16670 478 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CCDC155Q8N6L0 562 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 NAIPQ13075 1403 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 KANK3Q6NY19 840 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 TSC1Q92574 1164 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 TSG101Q99816 390 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.549e-8■■■□□ 16.5
CTIF-201ENST00000256413 TIAM1Q13009 1591 aa18.41■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CPLX4Q7Z7G2 160 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-201ENST00000256413 OAS2P29728 719 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 SYKP43405 635 aa18.39■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 KARSQ15046 597 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.39■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 STAMBPO95630 424 aa18.39■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V1AP38606 617 aa18.39■□□□□ 0.53
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