RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 KIF5BP33176 963 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC96Q2M329 555 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 KIF20AO95235 890 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 PDE4BQ07343 736 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 TSG101Q99816 390 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 FLT4P35916 1363 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 C6orf229H3BNL8 230 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 PAF1Q8N7H5 531 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.04■■□□□ 1.12
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PTPRE-201ENST00000254667 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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PTPRE-201ENST00000254667 RFC4P35249 363 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTPRE-201ENST00000254667 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 ZFYVE9O95405 1425 aa22.02■■□□□ 1.12
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PTPRE-201ENST00000254667 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 POTEJP0CG39 1038 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 GSTO1P78417 241 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.02■■□□□ 1.12
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PTPRE-201ENST00000254667 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRE-201ENST00000254667 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.02■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 KSR2Q6VAB6 950 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ST5P78524 1137 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 KIAA1328Q86T90 577 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 USP16Q9Y5T5 823 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 POLKQ9UBT6 870 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 NBPF4Q96M43 638 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 GRM8O00222 908 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 ZSCAN12O43309 604 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 STX6O43752 255 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 GJB2P29033 226 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ATP8B2P98198 1209 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 COPS6Q7L5N1 327 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ESPNB1AK53 854 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 GUCY1B3Q02153 619 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
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PTPRE-201ENST00000254667 KAT14Q9H8E8 782 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 IGHDP01880 384 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 CNNM3Q8NE01 707 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 TSPY2A6NKD2 308 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRE-201ENST00000254667 ABCC1P33527 1531 aa21.97■■□□□ 1.11
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