RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.58■■□□□ 1.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SPG7Q9UQ90 795 aa26.58■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS53Q5VIR6 699 aa26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 TCHHQ07283 1943 aa26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ABTB2Q8N961 1025 aa26.57■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ADCY9O60503 1353 aa26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 USP25Q9UHP3 1055 aa26.56■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 LARGE1O95461 756 aa26.55■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 LGR6Q9HBX8 967 aa26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MTMR6Q9Y217 621 aa26.54■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ADCY5O95622 1261 aa26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PTH1RQ03431 593 aa26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 IP6K1Q92551 441 aa26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.53■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 CPA1P15085 419 aa26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 GJB2P29033 226 aa26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ZMYND15Q9H091 742 aa26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.52■■□□□ 1.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FIBPO43427 364 aa26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 KDM4AO75164 1064 aa26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH1L1O75891 902 aa26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 NECTIN1Q15223 517 aa26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.51■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNQ3O43525 872 aa26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 EVI5LQ96CN4 794 aa26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 GPATCH3Q96I76 525 aa26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 NBPF4Q96M43 638 aa26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 LTN1O94822 1766 aa26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ST3GAL1Q11201 340 aa26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 MYRIPQ8NFW9 859 aa26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 NFAT5O94916 1531 aa26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 BTBD11A6QL63 1104 aa26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ANXA1P04083 346 aa26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 SNRKQ9NRH2 765 aa26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1-201ENST00000218364 TEFQ10587 303 aa26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 ME3Q16798 604 aa26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNA6P17658 529 aa26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 KSR2Q6VAB6 950 aa26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP4K1Q92918 833 aa26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 HIP1O00291 1037 aa26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 MPNDQ8N594 471 aa26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 NCAPD2Q15021 1401 aa26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 AACSQ86V21 672 aa26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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