RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 CNPY2Q9Y2B0 182 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 SYT1P21579 422 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 USP44Q9H0E7 712 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF1AQ12756 1690 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 SLIT3O75094 1523 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 GCP02774 474 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 NBPF4Q96M43 638 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 AK2P54819 239 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF3AQ9Y496 699 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 IL25Q9H293 177 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 IL17REQ8NFR9 667 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 RUFY3Q7L099 469 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 VPS53Q5VIR6 699 aa27.3■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 RUFY2Q8WXA3 655 aa27.3■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 ATF3P18847 181 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA1524Q8TCG1 905 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNB2Q92953 911 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM94Q12767 1356 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 HYPKQ9NX55 129 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC192P0DO97 292 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF710Q8N1W2 664 aa27.26■■□□□ 1.96
ANKRD54-201ENST00000215941 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 RASEFQ8IZ41 740 aa27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 MTMR6Q9Y217 621 aa27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC171Q6TFL3 1326 aa27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 FIBPO43427 364 aa27.25■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 MST1RQ04912 1400 aa27.25■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 ELP1O95163 1332 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 GJB2P29033 226 aa27.23■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 CASTP20810 708 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 DMTNQ08495 405 aa27.22■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 DCCP43146 1447 aa27.22■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 HOXB7P09629 217 aa27.22■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.22■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.22■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.22■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.21■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 ALS2Q96Q42 1657 aa27.21■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 SRGAP3O43295 1099 aa27.21■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM200AQ8TCP9 573 aa27.21■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.21■■□□□ 1.95
ANKRD54-201ENST00000215941 HSPA2P54652 639 aa27.2■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.2■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 PDCP20941 246 aa27.19■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 NCAPD2Q15021 1401 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNF1Q9H3M0 494 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 CTIFO43310 598 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT85P78386 507 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 MTX1Q13505 466 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 GPATCH3Q96I76 525 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.17■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.17■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 LGR6Q9HBX8 967 aa27.17■■□□□ 1.94
ANKRD54-201ENST00000215941 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms