RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042850.8

Svep1-201, Transcript of Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Svep1, Length 11,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1-201ENSMUST00000042850 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
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Svep1-201ENSMUST00000042850 Klhl10Q9D5V2 608 aa10.58□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa10.58□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 St5Q924W7 1134 aa10.58□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa10.58□□□□□ -0.72
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Svep1-201ENSMUST00000042850 Krt13P08730 437 aa10.57□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cct2P80314 535 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Mctp2Q5RJH2 878 aa10.57□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Mcur1Q9CXD6 340 aa10.57□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Palm3A2TJV2 734 aa10.57□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa10.57□□□□□ -0.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
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